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目的 在建立氡染毒小鼠模型的基础上,筛选和鉴定氡染毒小鼠外周血细胞差异表达基因.方法 采用HD-3型多功能氡室对BALB/c小鼠动态吸入染毒,建立实验动物模型.按照小鼠吸入氡及其子体的累积剂量分为实验组(累积剂量105 WLM)和对照组(室内本底浓度,1 WLM).采用RNA转录物5'末端启动机制技术(SMART)和抑制性消减杂交技术(SSH)构建正、反向消减cDNA文库,选取含有插入cDNA片段的克隆进行反向Northern杂交筛选上调或下调的阳性克隆.克隆的测序结果进行同源性检索和生物信息学分析.结果 在成功构建了消减cDNA文库基础上,挑取白斑390个,获得312个含有插入片段的单克隆,进行反向Northern杂交,分析基因的上调或下调水平.选取差异表达克隆41个进行测序及生物信息学分析,最终获得10条已知功能或有注释的差异基因片段和3条未知的表达序列标签(EST).筛选出的差异表达基因涉及氧化损伤、细胞增殖和肿瘤发生等多方面的功能.结论 氡染毒可引起一系列基因表达的上调或下调,利用SSH技术可以筛选到氡染毒的差异表达基因,为探讨氡损伤机制提供参考.

作者:陈锐;李建祥;聂继华;施敏骅;胡华成;童建

来源:中华放射医学与防护杂志 2009 年 29卷 1期

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作者:
陈锐;李建祥;聂继华;施敏骅;胡华成;童建
来源:
中华放射医学与防护杂志 2009 年 29卷 1期
标签:
氡 抑制消减杂交 差异表达基因 生物信息学 Radon Suppression subtractive hybridization Differential expression genes Bioinformatics
目的 在建立氡染毒小鼠模型的基础上,筛选和鉴定氡染毒小鼠外周血细胞差异表达基因.方法 采用HD-3型多功能氡室对BALB/c小鼠动态吸入染毒,建立实验动物模型.按照小鼠吸入氡及其子体的累积剂量分为实验组(累积剂量105 WLM)和对照组(室内本底浓度,1 WLM).采用RNA转录物5'末端启动机制技术(SMART)和抑制性消减杂交技术(SSH)构建正、反向消减cDNA文库,选取含有插入cDNA片段的克隆进行反向Northern杂交筛选上调或下调的阳性克隆.克隆的测序结果进行同源性检索和生物信息学分析.结果 在成功构建了消减cDNA文库基础上,挑取白斑390个,获得312个含有插入片段的单克隆,进行反向Northern杂交,分析基因的上调或下调水平.选取差异表达克隆41个进行测序及生物信息学分析,最终获得10条已知功能或有注释的差异基因片段和3条未知的表达序列标签(EST).筛选出的差异表达基因涉及氧化损伤、细胞增殖和肿瘤发生等多方面的功能.结论 氡染毒可引起一系列基因表达的上调或下调,利用SSH技术可以筛选到氡染毒的差异表达基因,为探讨氡损伤机制提供参考.