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目的 建立一种HBV耐药突变的反向杂交检测方法,并对该方法进行优化和评估.方法 针对拉米夫定、阿德福韦酯和恩替卡韦3种药物10个耐药位点的常见耐药突变形式,合成兼顾HBV 8种基因型的26条简并探针,并固定于同一张带正电荷的尼龙膜上,与地高辛标记的待测样本聚合酶链反应(PCR)产物进行杂交.为了提高检测灵敏度和特异性,从PCR产物标记地高辛的数目,紫外交联探针的能量强度,以及杂交和严格洗脱4个方面进行优化.为了证实方法的可行性,从检测特异性、灵敏度和临床标本的检测准确性3个方面进行评估.结果 当检测体系为引物标记3个地高辛分子,紫外交联的能量强度选择1500× 0.1 mJ/cm2,杂交温度选择42℃,严格洗脱条件选择44℃,用0.5 ×SSC和0.1%十二烷基硫酸钠严格洗脱30 min时,可获得灵敏、特异的结果.在该检测体系的评估中,当PCR产量在10 mg/L以上,可以被检测到,且绝大多数探针特异性较好.临床标本的检测结果与直接测序法的检测结果符合率为93.9% (31/33).结论 该方法可以对HBV拉米夫定、阿德福韦和恩替卡韦耐药突变同时进行检测,是一种简便、快速、灵敏的分析方法,但部分探针的特异性有待进一步提高.对于180/181、202/204这4个位点的探针,由于两两距离较近,同一探针序列包含2个位点的密码子,杂交会相互干

作者:刘彦辰;黄爱龙;胡源;胡接力;赖国旗;张文露

来源:中华肝脏病杂志 2011 年 19卷 12期

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作者:
刘彦辰;黄爱龙;胡源;胡接力;赖国旗;张文露
来源:
中华肝脏病杂志 2011 年 19卷 12期
标签:
肝炎病毒,乙型 寡核苷酸序列分析 核苷(酸)类似物 耐药 反向杂交 Hepatitis B virus Oligonucleotide array sequence analysis Nucleoside analogues Drug-resistance Reverse hybridization
目的 建立一种HBV耐药突变的反向杂交检测方法,并对该方法进行优化和评估.方法 针对拉米夫定、阿德福韦酯和恩替卡韦3种药物10个耐药位点的常见耐药突变形式,合成兼顾HBV 8种基因型的26条简并探针,并固定于同一张带正电荷的尼龙膜上,与地高辛标记的待测样本聚合酶链反应(PCR)产物进行杂交.为了提高检测灵敏度和特异性,从PCR产物标记地高辛的数目,紫外交联探针的能量强度,以及杂交和严格洗脱4个方面进行优化.为了证实方法的可行性,从检测特异性、灵敏度和临床标本的检测准确性3个方面进行评估.结果 当检测体系为引物标记3个地高辛分子,紫外交联的能量强度选择1500× 0.1 mJ/cm2,杂交温度选择42℃,严格洗脱条件选择44℃,用0.5 ×SSC和0.1%十二烷基硫酸钠严格洗脱30 min时,可获得灵敏、特异的结果.在该检测体系的评估中,当PCR产量在10 mg/L以上,可以被检测到,且绝大多数探针特异性较好.临床标本的检测结果与直接测序法的检测结果符合率为93.9% (31/33).结论 该方法可以对HBV拉米夫定、阿德福韦和恩替卡韦耐药突变同时进行检测,是一种简便、快速、灵敏的分析方法,但部分探针的特异性有待进一步提高.对于180/181、202/204这4个位点的探针,由于两两距离较近,同一探针序列包含2个位点的密码子,杂交会相互干