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目的 筛选小鼠前成骨细胞(MC3T3-E1)miR-381-3p实验组(MC3-E1-mi)和对照组(MC3-E1-NC-mi)的差异蛋白,分析其生物学功能及相关信号通路.方法 慢病毒转染构建实验组与对照组细胞,荧光定时定量PCR验证转染结果;收集细胞样品提取蛋白并筛选差异蛋白;对差异蛋白数据进行GO注释及KEGG通路富集分析.结果 共筛选出了4774种差异表达蛋白,其中288种差异显著,表达上调138种,表达下调150种.GO富集结果显示,差异蛋白参与的生物过程主要为基因复制与转录、蛋白质修饰;参与的分子功能主要为转移酶活性、转移含磷基团;差异蛋白的细胞组分多为细胞膜与细胞核.KEGG通路富集分析显示,差异蛋白涉及的主要通路为泛素介导的蛋白水解、线粒体自噬、胰高糖素信号通路、糖类代谢,与成骨密切相关的通路有AMPK、PI3K/Akt、mTOR及Notch信号通路.结论 筛选出Arsb、CCN2、COL11A1、ADAM17、CCN3和fibrillin-1差异表达显著,AMPK、PI3K/Akt、mTOR及Notch信号通路可能是肌少-骨质疏松症的研究方向.

作者:秦晓飞;陈锦成;朱国涛;罗骏;徐杰

来源:中华骨质疏松和骨矿盐疾病杂志 2022 年 15卷 1期

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作者:
秦晓飞;陈锦成;朱国涛;罗骏;徐杰
来源:
中华骨质疏松和骨矿盐疾病杂志 2022 年 15卷 1期
标签:
肌少-骨质疏松症 MC3T3-E1细胞 生物信息学分析
目的 筛选小鼠前成骨细胞(MC3T3-E1)miR-381-3p实验组(MC3-E1-mi)和对照组(MC3-E1-NC-mi)的差异蛋白,分析其生物学功能及相关信号通路.方法 慢病毒转染构建实验组与对照组细胞,荧光定时定量PCR验证转染结果;收集细胞样品提取蛋白并筛选差异蛋白;对差异蛋白数据进行GO注释及KEGG通路富集分析.结果 共筛选出了4774种差异表达蛋白,其中288种差异显著,表达上调138种,表达下调150种.GO富集结果显示,差异蛋白参与的生物过程主要为基因复制与转录、蛋白质修饰;参与的分子功能主要为转移酶活性、转移含磷基团;差异蛋白的细胞组分多为细胞膜与细胞核.KEGG通路富集分析显示,差异蛋白涉及的主要通路为泛素介导的蛋白水解、线粒体自噬、胰高糖素信号通路、糖类代谢,与成骨密切相关的通路有AMPK、PI3K/Akt、mTOR及Notch信号通路.结论 筛选出Arsb、CCN2、COL11A1、ADAM17、CCN3和fibrillin-1差异表达显著,AMPK、PI3K/Akt、mTOR及Notch信号通路可能是肌少-骨质疏松症的研究方向.