目的:比较二代测序(NGS)检测方法在痰标本和结核分枝杆菌菌株中耐药性的诊断效能,从而探讨NGS方法检测痰标本耐药性的可行性。方法:本研究属于回顾性研究,收集了北京胸科医院2017年1—12月收治50例肺结核患者的痰标本和相应的临床分离菌株。用NGS方法分别检测痰标本和相应的临床分离菌株
katG、
inhA、
rpoB、
embA、
embB、
rpsL、
rrs、
gyrA、
gyrB、
tlyA的基因突变。采用比例法对菌株进行表型药敏试验(drug susceptibility test,DST)。以DST结果为参考,分别计算临床菌株NGS方法、痰标本NGS方法敏感度、特异度、阳性预测值和阴性预测值,以及与表型DST的一致性统计量(
Kappa)。对于NGS检测在痰标本和菌株样本中的准确性比较用
χ2检验。
结果:在各种突变基因中,
rpoB(63.83
作者:刘原园;石金;初平;吴托雅;李璐;逄宇;鲁洁;郭永丽
来源:中华结核和呼吸杂志 2022 年 45卷 6期