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目的 检测侵袭性牙周炎(aggressive periodontitis,AgP)患者牙龈组织与健康牙龈中长链非编码RNA (long non-coding RNA,lncRNA)的差异性表达谱,探索其在AgP发病机制中的作用.方法 收集上海交通大学医学院附属第九人民医院牙周病科(2012年3月至2012年8月)和天津医科大学口腔医院牙周科(2016年10月至2017年4月)AgP患者和牙周健康者的牙龈组织各40例(患者均知情同意),其中两组各20例用于lncRNA基因芯片检测lncRNA和mRNA差异性表达谱,并对所得数据进行生物信息学分析.选择表达差异明显的两个IncRNA:IncRNA-API5和lncRNA-TNFRSF13C,利用实时荧光定量PCR方法在两组其余牙龈组织样本中检测和验证.结果 与健康牙龈组织相比,AgP患者牙龈组织中存在8 632种lncRNA差异性表达,其中1 986种lncRNA明显上调,6646种lncRNA下调,上调丰度差异率>10的lncRNA 48个(P<0.05),下调丰度差异率>10的lncRNA 14个(P<0.05);5 519种mRNA的表达存在差异,其中1 676种mRNA表达上调≥2倍(P<0.05),3 843种mRNA表达下调≤0.5(P<0.05).进一步验证显示:IncRNA-API5和IncRNA-TNFRSF13C在AgP患者牙龈组织中表达显著升高(P<0.05),与芯片检测结果一致.生物信息学分析显示:差异性表达的lncRNA与Toll样受体信号通路、细胞周期和凋亡相关通路、

作者:李佳珊;谢玉锋;宋立婷;王祥璞;蒋少云

来源:中华口腔医学杂志 2018 年 53卷 9期

知识库介绍

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作者:
李佳珊;谢玉锋;宋立婷;王祥璞;蒋少云
来源:
中华口腔医学杂志 2018 年 53卷 9期
标签:
侵袭性牙周炎 长链非编码RNA 基因芯片分析 生物信息学分析 Aggressive periodontitis Long non-coding RNA Microarray Bioinformatics
目的 检测侵袭性牙周炎(aggressive periodontitis,AgP)患者牙龈组织与健康牙龈中长链非编码RNA (long non-coding RNA,lncRNA)的差异性表达谱,探索其在AgP发病机制中的作用.方法 收集上海交通大学医学院附属第九人民医院牙周病科(2012年3月至2012年8月)和天津医科大学口腔医院牙周科(2016年10月至2017年4月)AgP患者和牙周健康者的牙龈组织各40例(患者均知情同意),其中两组各20例用于lncRNA基因芯片检测lncRNA和mRNA差异性表达谱,并对所得数据进行生物信息学分析.选择表达差异明显的两个IncRNA:IncRNA-API5和lncRNA-TNFRSF13C,利用实时荧光定量PCR方法在两组其余牙龈组织样本中检测和验证.结果 与健康牙龈组织相比,AgP患者牙龈组织中存在8 632种lncRNA差异性表达,其中1 986种lncRNA明显上调,6646种lncRNA下调,上调丰度差异率>10的lncRNA 48个(P<0.05),下调丰度差异率>10的lncRNA 14个(P<0.05);5 519种mRNA的表达存在差异,其中1 676种mRNA表达上调≥2倍(P<0.05),3 843种mRNA表达下调≤0.5(P<0.05).进一步验证显示:IncRNA-API5和IncRNA-TNFRSF13C在AgP患者牙龈组织中表达显著升高(P<0.05),与芯片检测结果一致.生物信息学分析显示:差异性表达的lncRNA与Toll样受体信号通路、细胞周期和凋亡相关通路、