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目的 利用蛋白质组学技术筛选并鉴定特发性肺间质纤维化患者和健康人血清差异表达蛋白.方法 收集山东大学第二医院于2014年10月至2015年10月收治的30例特发性肺间质纤维化患者及健康人血清各30份,组内等量混合后,去除高丰度蛋白,经同位素标记相对和绝对定量试剂标记后采用二维液相色谱一串联质谱鉴定并进行相对定量.对鉴定出的差异蛋白进行基因功能聚类(GO)分析和通路富集分析,筛选出与特发性肺间质纤维化发生相关的蛋白质.结果 质谱鉴定出置信度>95%的蛋白质共490个,其中差异表达蛋白25个.与对照组相比,25个差异蛋白中有4个表达上调,21个表达下调.GO分析显示,大多数差异蛋白处于细胞外区域(92%);通路富集分析显示,含差异蛋白数量最多的通路为补体和凝血级联通路.结论 特发性肺间质纤维化患者血清中鉴定出了与补体及凝血相关的差异蛋白,其具体功能有待进一步研究.

作者:张颖;王超超;牛瑞

来源:中华流行病学杂志 2018 年 39卷 8期

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作者:
张颖;王超超;牛瑞
来源:
中华流行病学杂志 2018 年 39卷 8期
标签:
特发性肺间质纤维化 蛋白质组学 血清生物标志物 Idiopathic pulmonary fibrosis Proteomics Serum biomarkers
目的 利用蛋白质组学技术筛选并鉴定特发性肺间质纤维化患者和健康人血清差异表达蛋白.方法 收集山东大学第二医院于2014年10月至2015年10月收治的30例特发性肺间质纤维化患者及健康人血清各30份,组内等量混合后,去除高丰度蛋白,经同位素标记相对和绝对定量试剂标记后采用二维液相色谱一串联质谱鉴定并进行相对定量.对鉴定出的差异蛋白进行基因功能聚类(GO)分析和通路富集分析,筛选出与特发性肺间质纤维化发生相关的蛋白质.结果 质谱鉴定出置信度>95%的蛋白质共490个,其中差异表达蛋白25个.与对照组相比,25个差异蛋白中有4个表达上调,21个表达下调.GO分析显示,大多数差异蛋白处于细胞外区域(92%);通路富集分析显示,含差异蛋白数量最多的通路为补体和凝血级联通路.结论 特发性肺间质纤维化患者血清中鉴定出了与补体及凝血相关的差异蛋白,其具体功能有待进一步研究.