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目的:分析2008-2017年广州市注射吸毒人群HIV-1分子网络的分布特征,为该人群艾滋病防控提供参考依据。方法:选取2008-2017年广州市新确证的注射吸毒HIV-1感染者血清样本,进行 pol区基因扩增及测序后,利用Cluster Picker 1.2.3软件识别系统进化树中的分子簇,使用HyPhy 2.2.4中TN93模型计算成簇序列间的基因距离,通过可视化软件Cytoscape 3.8.2构建分子网络,采用 χ2检验或确切概率法进行成簇分析和中心性分析。 结果:成功扩增获得 pol区基因片段586条(73.9

作者:曾文婷;韩志刚;吴昊;黎庆梅;梁彩云;徐理倩;赵新华

来源:中华流行病学杂志 2021 年 42卷 7期

知识库介绍

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作者:
曾文婷;韩志刚;吴昊;黎庆梅;梁彩云;徐理倩;赵新华
来源:
中华流行病学杂志 2021 年 42卷 7期
标签:
艾滋病病毒 注射吸毒人群 分子网络 成簇分析 中心性分析 HIV Injected drug user Molecular network Cluster analysis Centrality analysis
目的:分析2008-2017年广州市注射吸毒人群HIV-1分子网络的分布特征,为该人群艾滋病防控提供参考依据。方法:选取2008-2017年广州市新确证的注射吸毒HIV-1感染者血清样本,进行 pol区基因扩增及测序后,利用Cluster Picker 1.2.3软件识别系统进化树中的分子簇,使用HyPhy 2.2.4中TN93模型计算成簇序列间的基因距离,通过可视化软件Cytoscape 3.8.2构建分子网络,采用 χ2检验或确切概率法进行成簇分析和中心性分析。 结果:成功扩增获得 pol区基因片段586条(73.9