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目的 明确分化抑制因子3(Id3)能否作为缺血性脑卒中(IS)潜在的诊断标志物,并研究免疫细胞浸润在IS病理中的作用.方法 从基因表达综合数据库中下载IS数据集.首先使用R语言软件识别差异表达基因并进行功能相关分析.然后结合最小绝对收缩与选择算子、支持向量机的特征递减消除算法和加权基因共表达网络分析算法筛选IS的诊断标志物并进一步验证,通过受试者工作特征曲线评估标志物对IS的诊断价值.最后,利用反卷积算法评价IS组织中免疫细胞浸润情况,分析诊断标志物与浸润免疫细胞的相关性.结果 本研究总共确定了165个差异表达基因,发现Id3可能是IS的诊断标志物(受试者工作特征曲线下面积0.839,95%置信区间:0.750~0.920).免疫细胞浸润分析表明,中性粒细胞、初始CD4+T淋巴细胞、初始B细胞、CD8+T淋巴细胞、静息CD4+记忆T淋巴细胞、活化CD4+记忆T淋巴细胞、静息树突状细胞、静息肥大细胞、嗜酸性粒细胞与IS的发生进展可能存在关系.结论 Id3可能是IS潜在的诊断基因,免疫细胞浸润对IS的发生发展有重要影响.

作者:古联;梁一帆;杨怡冰;刘晶;曾文璐;申婷婷

来源:中国医药 2023 年 18卷 3期

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作者:
古联;梁一帆;杨怡冰;刘晶;曾文璐;申婷婷
来源:
中国医药 2023 年 18卷 3期
标签:
缺血性脑卒中 分化抑制因子3 诊断标志物 免疫细胞 基因表达的综合 分子机制
目的 明确分化抑制因子3(Id3)能否作为缺血性脑卒中(IS)潜在的诊断标志物,并研究免疫细胞浸润在IS病理中的作用.方法 从基因表达综合数据库中下载IS数据集.首先使用R语言软件识别差异表达基因并进行功能相关分析.然后结合最小绝对收缩与选择算子、支持向量机的特征递减消除算法和加权基因共表达网络分析算法筛选IS的诊断标志物并进一步验证,通过受试者工作特征曲线评估标志物对IS的诊断价值.最后,利用反卷积算法评价IS组织中免疫细胞浸润情况,分析诊断标志物与浸润免疫细胞的相关性.结果 本研究总共确定了165个差异表达基因,发现Id3可能是IS的诊断标志物(受试者工作特征曲线下面积0.839,95%置信区间:0.750~0.920).免疫细胞浸润分析表明,中性粒细胞、初始CD4+T淋巴细胞、初始B细胞、CD8+T淋巴细胞、静息CD4+记忆T淋巴细胞、活化CD4+记忆T淋巴细胞、静息树突状细胞、静息肥大细胞、嗜酸性粒细胞与IS的发生进展可能存在关系.结论 Id3可能是IS潜在的诊断基因,免疫细胞浸润对IS的发生发展有重要影响.