目的 筛选并分析厄洛替尼耐药的非小细胞肺癌细胞的差异表达mRNAs和lncRNAs.方法 在Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中挑选数据集GSE80344,其数据来自厄洛替尼耐药的HCC827细胞和敏感细胞.通过GEO2R和探针匹配分析差异表达mRNAs和lncRNAs,筛选标准为|Fold change|>1.5,P value<0.01.通过Panther(http://www.pantherdb.org)、KEGG(http://www.kegg.jp/)、STRING(http://string-db.org)等数据库分析筛选得到的差异表达mRNAs和lncRNAs的可能的作用机制.通过TCGA(https://cancergenome.nih.gov/)数据库对筛选得到的关键mRNAs和lncRNAs进行生存分析验证.结果 厄洛替尼耐药的HCC827细胞和敏感细胞相比,差异表达mRNAs共644个,差异表达lncRNAs共367个,其中128 mRNAs表达上调,516 mRNAs表达下调;137 lncRNAs表达上调,230 lncRNAs表达下调.这些mRNAs和lncRNAs主要涉及在PI3K-Akt、Ras、MAPK、ECM受体相互作用等与癌症密切相关的信号通路中发挥作用.基于数据库的分析验证结果与筛选结果一致.结论 筛选分析得到的关健mRNAs和lncRNAs可为深入研究非小细胞肺癌EGFR-TKIs耐药机制的前期实验依据.
作者:李树斌;于鸿;张耿月
来源:中华肺部疾病杂志(电子版) 2020 年 13卷 3期