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目的 同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术在人黑素瘤A375细胞系中筛选let-7a潜在的靶标蛋白,探讨let-7a的抑癌机制.方法 100 nmol/L let-7a模拟物及其对照转染A375细胞,提取细胞总蛋白,运用同位素标记的iTRAQ技术分析和鉴定差异表达的蛋白质,运用生物信息学分析let-7a靶标蛋白及其功能,采用双荧光素酶报告系统验证靶标.结果 let-7a模拟物组和对照组相比,质谱共分析鉴定到327个显著差异蛋白,其中表达量上调>1.2倍的蛋白有151种,下调<0.8倍的蛋白有176种.下调的176种蛋白中,软件预测到结合靶标有47个,双荧光素酶报告系统验证表明,let-Ta模拟物组与对照组相比,HMGA2和THOC2野生型3'UTR比值分别降低64.3%和46.4%.结论 iTRAQ技术和生物信息学方法在人黑素瘤A375细胞系中筛选出47个let-7a候选靶标蛋白,其中HMGA2和THOC2分别为let-7a的靶标.

作者:王焱;张倩;周晓伟;王震英;方方;孙建方

来源:中华皮肤科杂志 2016 年 49卷 5期

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作者:
王焱;张倩;周晓伟;王震英;方方;孙建方
来源:
中华皮肤科杂志 2016 年 49卷 5期
标签:
黑色素瘤 细胞系,肿瘤 微RNAs 蛋白质组学 iTRAQ Melanoma Cell line,tumor MicroRNAs Proteomics iTRAQ
目的 同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术在人黑素瘤A375细胞系中筛选let-7a潜在的靶标蛋白,探讨let-7a的抑癌机制.方法 100 nmol/L let-7a模拟物及其对照转染A375细胞,提取细胞总蛋白,运用同位素标记的iTRAQ技术分析和鉴定差异表达的蛋白质,运用生物信息学分析let-7a靶标蛋白及其功能,采用双荧光素酶报告系统验证靶标.结果 let-7a模拟物组和对照组相比,质谱共分析鉴定到327个显著差异蛋白,其中表达量上调>1.2倍的蛋白有151种,下调<0.8倍的蛋白有176种.下调的176种蛋白中,软件预测到结合靶标有47个,双荧光素酶报告系统验证表明,let-Ta模拟物组与对照组相比,HMGA2和THOC2野生型3'UTR比值分别降低64.3%和46.4%.结论 iTRAQ技术和生物信息学方法在人黑素瘤A375细胞系中筛选出47个let-7a候选靶标蛋白,其中HMGA2和THOC2分别为let-7a的靶标.