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目的探 讨核糖体结合糖蛋白2(RPN2)在脑胶质瘤中的表达模式,以及其与患者的临床特征及预后的关系.方法 回顾性分析309例来自中国脑胶质瘤基因组图谱数据库(CGGA)的脑胶质瘤患者的临床资料及其mRNA测序数据,分析RPN2基因的表达模式.对2016-2017年首都医科大学附属北京天坛医院收治的30例脑胶质瘤患者肿瘤样本采用实时荧光定量PCR验证RPN2基因的表达情况.根据RPN2基因的表达水平,将所有样本分为低表达组(154例)和高表达组(155例).以癌症基因组图谱数据库(TCGA)的mRNA测序数据和REMBRANDT的mRNA芯片数据作为独立验证数据集.采用方差分析和t检验分析RPN2基因的表达特征.应用Kaplan-Meier生存曲线、Log-rank检验以及Cox回归分析方法评价RPN2基因在脑胶质瘤患者预后评估中的作用.通过DAVID软件分析RPN2基因参与的GO生物学过程和KEGG信号通路.结果 CGGA mRNA测序数据显示,在世界卫生组织(WHO)Ⅱ、Ⅲ以及Ⅳ级脑胶质瘤中,RPN2的表达水平呈升高趋势(分别为-0.55±0.61、0.05±0.66以及0.36±1.20,P<0.0001);实时荧光定量PCR也证实,RPN2的表达水平随胶质瘤WHO等级的升高呈逐渐升高的趋势.在TCGA脑胶质瘤的4个分型中,RPN2在神经元型中表达最低,在间质型中表达最高(分别为-0.80±0.56和0.68±1.02,P<0.001).RPN2在ID

作者:赵征;张克难;孙思;王政;王宽宇;黄若愚;胡慧敏;黄华;张莹

来源:中华神经外科杂志 2018 年 34卷 11期

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作者:
赵征;张克难;孙思;王政;王宽宇;黄若愚;胡慧敏;黄华;张莹
来源:
中华神经外科杂志 2018 年 34卷 11期
标签:
神经胶质瘤 基因表达谱 预后 核糖体结合糖蛋白2 生物学过程 Glioma Gene expression profiling Prognosis Ribophorin Ⅱ Biological process
目的探 讨核糖体结合糖蛋白2(RPN2)在脑胶质瘤中的表达模式,以及其与患者的临床特征及预后的关系.方法 回顾性分析309例来自中国脑胶质瘤基因组图谱数据库(CGGA)的脑胶质瘤患者的临床资料及其mRNA测序数据,分析RPN2基因的表达模式.对2016-2017年首都医科大学附属北京天坛医院收治的30例脑胶质瘤患者肿瘤样本采用实时荧光定量PCR验证RPN2基因的表达情况.根据RPN2基因的表达水平,将所有样本分为低表达组(154例)和高表达组(155例).以癌症基因组图谱数据库(TCGA)的mRNA测序数据和REMBRANDT的mRNA芯片数据作为独立验证数据集.采用方差分析和t检验分析RPN2基因的表达特征.应用Kaplan-Meier生存曲线、Log-rank检验以及Cox回归分析方法评价RPN2基因在脑胶质瘤患者预后评估中的作用.通过DAVID软件分析RPN2基因参与的GO生物学过程和KEGG信号通路.结果 CGGA mRNA测序数据显示,在世界卫生组织(WHO)Ⅱ、Ⅲ以及Ⅳ级脑胶质瘤中,RPN2的表达水平呈升高趋势(分别为-0.55±0.61、0.05±0.66以及0.36±1.20,P<0.0001);实时荧光定量PCR也证实,RPN2的表达水平随胶质瘤WHO等级的升高呈逐渐升高的趋势.在TCGA脑胶质瘤的4个分型中,RPN2在神经元型中表达最低,在间质型中表达最高(分别为-0.80±0.56和0.68±1.02,P<0.001).RPN2在ID