目的:基于转录组学数据筛选影响脑胶质瘤恶性进展及替莫唑胺耐药的关键基因,分析其在脑胶质瘤中的表达及意义。方法:本研究通过分析GSE23806数据库(63株细胞株)、癌症体细胞突变目录(COSMIC)数据库(34株细胞株)及中国脑胶质瘤基因组图谱(CGGA)计划数据库(325例患者)中的转录组学数据,分别筛选出在胶质瘤干细胞中高表达的差异基因、在替莫唑胺耐药细胞中高表达的差异基因以及与胶质母细胞瘤恶性预后相关的基因,进而筛选出共同差异基因。通过CGGA与癌症基因组图谱(TCGA)计划数据库(636例患者)验证该基因在不同世界卫生组织(WHO)级别、不同四分型亚型的脑胶质瘤中的表达差异;采用Kaplan-Meier生存曲线比较该基因表达量不同的胶质母细胞瘤患者总生存期的差异;通过单因素和多因素Cox回归分析研究该基因对脑胶质瘤患者总生存期的影响;通过基因本体(GO)功能富集分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析预测其潜在的生物学功能。结果:通过分析共同差异基因,筛选出岩藻糖基转移酶Ⅶ(
FUT7)作为目标基因。
FUT7在胶质瘤干细胞中呈现高表达(
P=0.025),且在替莫唑胺耐药的细胞中高表达(
P=0.033)。在CGGA数据库(325例)和TCGA数据库(636例)中,
FUT7在WHO Ⅱ、Ⅲ及
作者:黄华;王宽宇;王志亮;江涛
来源:中华神经外科杂志 2020 年 36卷 7期