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目的 分析和验证白纹伊蚊(佛山株)基因组中的登革病毒来源的内源性病毒序列(endogenous viral elements,EVEs).方法 使用Blast序列比对工具,分别以四型登革病毒基因组全序列为待查序列对白纹伊蚊基因组进行序列比对分析.根据筛选得到的EVEs序列设计基因特异性引物,分别以雌、雄各8只成蚊个体进行基因组PCR检测并测序验证.结果 在白纹伊蚊基因组上共计找到5个与登革病毒高度同源性的EVEs片段.其中,EVE-1与DENV-2 P8-1407MS株、EVE-2-5与DENV-1 02-20株具有高度的相似性.基因组PCR检测结果显示,EVE-1在种群个体中保守存在,而EVE-2未检测到,EVE-3-5在不同个体中变异度较高.结论 白纹伊蚊基因组中存在登革病毒序列来源的EVEs,为研究登革病毒与媒介之间的相互作用提供了新的方向.

作者:王衍海;顾金保

来源:中华实验和临床病毒学杂志 2016 年 30卷 4期

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作者:
王衍海;顾金保
来源:
中华实验和临床病毒学杂志 2016 年 30卷 4期
标签:
登革热病毒 伊蚊属 内源性病毒序列 Dengue virus Aedes Endogenous viral elements
目的 分析和验证白纹伊蚊(佛山株)基因组中的登革病毒来源的内源性病毒序列(endogenous viral elements,EVEs).方法 使用Blast序列比对工具,分别以四型登革病毒基因组全序列为待查序列对白纹伊蚊基因组进行序列比对分析.根据筛选得到的EVEs序列设计基因特异性引物,分别以雌、雄各8只成蚊个体进行基因组PCR检测并测序验证.结果 在白纹伊蚊基因组上共计找到5个与登革病毒高度同源性的EVEs片段.其中,EVE-1与DENV-2 P8-1407MS株、EVE-2-5与DENV-1 02-20株具有高度的相似性.基因组PCR检测结果显示,EVE-1在种群个体中保守存在,而EVE-2未检测到,EVE-3-5在不同个体中变异度较高.结论 白纹伊蚊基因组中存在登革病毒序列来源的EVEs,为研究登革病毒与媒介之间的相互作用提供了新的方向.