目的:分析北京市一株人呼吸道合胞病毒(human respiratory syncytial virus, HRSV)A亚型全基因组序列的变异和遗传特征。方法:对北京友谊医院住院儿童鼻咽抽吸物样本核酸进行二代测序，获得了一株HRSV A亚型全基因组序列，与其他相关参考株构建系统发生树，并对主要蛋白编码区进行同源性分析、单核苷酸多态性分析以及N-糖基化位点预测。结果:系统发生树和同源性分析结果提示，本研究获得的HRSV病毒株(RSVA/Beijing-China/2017)属于A亚型ON1基因型。核苷酸和氨基酸变异分析表明G蛋白、F蛋白和L蛋白变异性较大。氨基酸变异位点分析显示G蛋白第142位发生了氨基酸替换(L142S)。F蛋白P27肽中(110-136aa)有一处氨基酸替换(S105N)，在抗原位点?(62-69aa和196-210aa)中也发生了氨基酸替换(C69Y)。N-糖基化位点预测发现该毒株的F蛋白N-糖基化位点有5个，G蛋白N-糖基化位点有4个。结论:本研究所得的HRSV毒株属于A亚型ON1基因型，G蛋白、F蛋白和L蛋白变异较大，G和F蛋白共发生22处氨基酸替换。
作者：郭琼；王超；黄益曼；张骞；王浩；麻粉莲；郑丽舒
来源：中华实验和临床病毒学杂志 2020 年 34卷 5期
