目的 通过生物信息学分析,明确胰腺癌中调节因子X相关蛋白(RFXAP)的表达水平,预测可能调控RFXAP表达的胰腺癌相关微小RNA(miRNA,miR),探索与RFXAP表达相关的基因和信号通路,从而有助于阐明胰腺癌中RFXAP的功能和表观遗传学机制.方法 检索GEO数据库分析胰腺癌基因芯片数据及其RFXAP表达水平;使用miRNA标靶数据库预测与RFXAP存在标靶关系的miRNA;利用TCGA数据库分析RFXAP共表达基因,进一步进行功能富集分析和信号通路富集分析.结果 RFXAP在胰腺癌中的表达明显低于癌旁组织;miR-27a等10种miRNA可能与RFXAP存在标靶关系,其中miR-27a、miR-27b、miR-212-3p为胰腺癌相关miRNA;在胰腺癌中与RFXAP相关性在0.5以上的基因有23个,RFXAP及其共表达基因富集于DNA结合、序列特异性DNA结合转录因子的活性调控等分子生物学功能.RFXAP可能参与Tuberculosis信号通路和Pancreatic cancer信号通路.结论 胰腺癌中存在RFXAP的低表达,并与多种胰腺癌相关miRNA有关,胰腺癌中RFXAP参与多种抑癌基因表达的转录调节,可能是一种潜在的抑癌基因.
作者：沈涛；丁国平；周良晶；曹利平
来源：中华实验外科杂志 2016 年 33卷 1期
