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目的 筛选出乙型肝炎病毒(HBV)相关性肝细胞癌(HCC)差异性表达的微小RNA(miRNA,miR),并进行生物学信息分析.方法 采用人类全基因表达谱芯片技术,筛选HBV相关性HCC、HBV相关性肝硬化和健康者3组miRNA差异的表达谱,并进行GO分析和KEGG pathway生物学分析.结果 与健康组比较,HBV相关性HCC血液样品中有17个差异表达的miRNA,HBV相关性肝硬化中有20个显著差异的miRNA;与肝硬化比较,HCC中有4个下调的和6个上调的miRNA.3组比较,hsa-miR-6127、hsa-miR-6879-Sp和hsa-miR-6510-5p在HCC中表达显著升高,而在健康组和肝硬化组处于低水平,生物学分析证实miRNA参与HBV相关性HCC血管生成、宿主免疫及信号通路等生物学过程.结论 HBV相关性HCC在成癌过程中与健康者和肝硬化患者有miRNA明显差异的表达谱,涉及靶基因的功能分类和信号传导途径.

作者:王玉柱;付强;张旭;秦涛

来源:中华实验外科杂志 2018 年 35卷 8期

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作者:
王玉柱;付强;张旭;秦涛
来源:
中华实验外科杂志 2018 年 35卷 8期
标签:
癌,肝细胞 微小RNA 生物信息学分析 乙型肝炎病毒 Carcinoma,hepatocellular MicroRNA Bioinformatics Hepatitis B Virus
目的 筛选出乙型肝炎病毒(HBV)相关性肝细胞癌(HCC)差异性表达的微小RNA(miRNA,miR),并进行生物学信息分析.方法 采用人类全基因表达谱芯片技术,筛选HBV相关性HCC、HBV相关性肝硬化和健康者3组miRNA差异的表达谱,并进行GO分析和KEGG pathway生物学分析.结果 与健康组比较,HBV相关性HCC血液样品中有17个差异表达的miRNA,HBV相关性肝硬化中有20个显著差异的miRNA;与肝硬化比较,HCC中有4个下调的和6个上调的miRNA.3组比较,hsa-miR-6127、hsa-miR-6879-Sp和hsa-miR-6510-5p在HCC中表达显著升高,而在健康组和肝硬化组处于低水平,生物学分析证实miRNA参与HBV相关性HCC血管生成、宿主免疫及信号通路等生物学过程.结论 HBV相关性HCC在成癌过程中与健康者和肝硬化患者有miRNA明显差异的表达谱,涉及靶基因的功能分类和信号传导途径.