目的:研究既往骨肉瘤患者和正常样本的代谢基因,探讨骨肉瘤肿瘤微环境中代谢基因的特性。方法:通过生物信息学分析参与肿瘤微环境(TME)免疫功能以及骨肉瘤患者生存和预后的代谢基因。将磷酸核糖氨基咪唑羧化酶,磷酸核糖氨基咪唑琥珀酰胺合成酶(PAICS基因)作为潜在的研究对象,探讨其在骨肉瘤细胞系中对细胞增殖、迁移和凋亡中的作用。结果:通过生物信息学分析,筛选出876个与软骨肉瘤OS(overall survival)相关的代谢基因和206个免疫相关代谢基因,将其相同基因进行聚类分析,分为三类:C1、C2和C3,其中C1集群的OS低于C2和C3(
P<0.01),C3集群的免疫评分高于C2和C3(
P<0.01)。流式细胞实验结果示HOS和MG-63细胞系si-PAICS-1和si-PAICS-2组的凋亡率均高于对照组,HOS细胞系si-PAICS-1组、si-PAICS-2组与对照组差异有统计学意义(
P<0.01);MG-63细胞系si-PAICS-1组、si-PAICS-2组与对照组差异有统计学意义(
P<0.01)。Transwell细胞迁移实验结果示,HOS和MG-63细胞系si-PAICS-1和si-PAICS-2组细胞数量低于对照组,HOS细胞系si-PAICS-1组、si-PAICS-2组与对照组差异有统计学意义(
P<0.01);MG-63细胞系si-PAICS-1组、si-PAICS-2组与对照组差异有统计学意义(
P<0.01)。
作者:马丽萍;朱忠培;宋瑞鹏;张书豪;杨浩;吴研飞
来源:中华实验外科杂志 2023 年 40卷 2期