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目的 研究西藏地区水痘-带状疱疹病毒临床分离株基因型.方法 将临床采集的水痘或带状疱疹患者皮肤水疱液接种至人胚胎成纤维细胞进行病毒分离;对分离得到的病毒运用间接免疫荧光法鉴定,鉴定结果为阳性的病毒继续体外培养以提取其基因组DNA.PCR法扩增并测序水痘-带状疱疹病毒基因组中开放读码框1、21、50、54的部分片段.测序结果与GenBank中水痘-带状疱疹病毒参考株Dumas进行序列比对分析其中单核苷酸多态性,并利用Primer 5.0软件进行酶切位点分析,从而确定基因型.结果 从临床采集的16份标本中经分离鉴定后得到10株水痘-带状疱疹病毒临床分离株,病毒分离阳性率为62.5%.基因分析结果显示西藏地区10株水痘-带状疱疹病毒临床分离株中基因型A1有3株,基因型A2有4株,基因型J1有3株.结论 西藏地区水痘-带状疱疹病毒基因型分布与西藏地区地理位置密切相关.

作者:刘兰;杜宝中;张勇仓;段亚平;甘霖;李长山

来源:中华微生物学和免疫学杂志 2012 年 32卷 11期

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作者:
刘兰;杜宝中;张勇仓;段亚平;甘霖;李长山
来源:
中华微生物学和免疫学杂志 2012 年 32卷 11期
标签:
水痘-带状疱疹病毒 单核苷酸多态性 基因型 西藏地区 Varicella-zoster virus Single nucleotide polymorphism Genotype Tibet area
目的 研究西藏地区水痘-带状疱疹病毒临床分离株基因型.方法 将临床采集的水痘或带状疱疹患者皮肤水疱液接种至人胚胎成纤维细胞进行病毒分离;对分离得到的病毒运用间接免疫荧光法鉴定,鉴定结果为阳性的病毒继续体外培养以提取其基因组DNA.PCR法扩增并测序水痘-带状疱疹病毒基因组中开放读码框1、21、50、54的部分片段.测序结果与GenBank中水痘-带状疱疹病毒参考株Dumas进行序列比对分析其中单核苷酸多态性,并利用Primer 5.0软件进行酶切位点分析,从而确定基因型.结果 从临床采集的16份标本中经分离鉴定后得到10株水痘-带状疱疹病毒临床分离株,病毒分离阳性率为62.5%.基因分析结果显示西藏地区10株水痘-带状疱疹病毒临床分离株中基因型A1有3株,基因型A2有4株,基因型J1有3株.结论 西藏地区水痘-带状疱疹病毒基因型分布与西藏地区地理位置密切相关.