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目的:阐明2010-2012年青岛地区手足口病( HFMD)病原谱及相关柯萨奇病毒A10( CVA10)型基因特征。方法用荧光RT-PCR法对HFMD患者咽拭子标本进行总肠道病毒( EV)、柯萨奇病毒A16(CVA16)型和肠道病毒71(EV71)型检测,然后用半巢式反转录PCR进行肠道病毒VP1基因部分序列扩增,再结合序列分析鉴定血清型;对CVA10阳性分离株进行VP1基因全长序列扩增及基因序列测定,用MEGA5.0软件进行系统发育分析及分子特征分析。结果2010-2012年间,共检测1919个手足口病门诊轻症病例和1336个住院重症病例;门诊轻症病例中,2010年和2012年以CVA16为主,各占轻症病例总阳性数的53%和73%,而2011年以EV71为主,占轻症病例总阳性数的78%;住院重症病例中,EV71为2010年和2011年主要病原,各占重症病例总阳性数的70%和86%;其他型别(非CVA16、非EV71)肠道病毒在2012年住院重症病例中成为主要病原,占重症病例总阳性数的44%;2010-2012年分别检出其他型别肠道病毒19株、16株和22株,其中CVA10检出率最高;23株CVA10的VP1全长基因序列进化分析表明这23株CVA10病毒全部属于C基因型,它们VP1基因氨基酸序列同源性为97.3%~100.0%,与其他地区同期参考株相比无显著差异。结论2010-2012年间,CVA16和EV71是引

作者:柴青;宫金伶;赵丹;史晓燕;于萍;汪照国

来源:中华微生物学和免疫学杂志 2014 年 10期

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作者:
柴青;宫金伶;赵丹;史晓燕;于萍;汪照国
来源:
中华微生物学和免疫学杂志 2014 年 10期
标签:
手足口病 肠道病毒 柯萨奇病毒A10 系统进化分析 Hand,foot and mouth disease Enterovirus Coxsackievirus A10 Phylogenetic analysis
目的:阐明2010-2012年青岛地区手足口病( HFMD)病原谱及相关柯萨奇病毒A10( CVA10)型基因特征。方法用荧光RT-PCR法对HFMD患者咽拭子标本进行总肠道病毒( EV)、柯萨奇病毒A16(CVA16)型和肠道病毒71(EV71)型检测,然后用半巢式反转录PCR进行肠道病毒VP1基因部分序列扩增,再结合序列分析鉴定血清型;对CVA10阳性分离株进行VP1基因全长序列扩增及基因序列测定,用MEGA5.0软件进行系统发育分析及分子特征分析。结果2010-2012年间,共检测1919个手足口病门诊轻症病例和1336个住院重症病例;门诊轻症病例中,2010年和2012年以CVA16为主,各占轻症病例总阳性数的53%和73%,而2011年以EV71为主,占轻症病例总阳性数的78%;住院重症病例中,EV71为2010年和2011年主要病原,各占重症病例总阳性数的70%和86%;其他型别(非CVA16、非EV71)肠道病毒在2012年住院重症病例中成为主要病原,占重症病例总阳性数的44%;2010-2012年分别检出其他型别肠道病毒19株、16株和22株,其中CVA10检出率最高;23株CVA10的VP1全长基因序列进化分析表明这23株CVA10病毒全部属于C基因型,它们VP1基因氨基酸序列同源性为97.3%~100.0%,与其他地区同期参考株相比无显著差异。结论2010-2012年间,CVA16和EV71是引