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目的 利用以核心家系为基础的关联研究探讨细胞色素P450酶系(cytochrome P450,CYP450)CYP1A1基因m1和m2多态性并分析其与鼻咽癌易感性的关联.方法 收集457个广东鼻咽癌核心家系(每个核心家系由患者和父母或同胞构成)共2134名成员作为研究对象,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法对CYPlAl基因单核苷酸多态性(SNP)位点m1和m2(其参考编号分别为rs4646903和rs1048943)进行基因分型.挑选PCR产物测序验证.运用家系为基础的相关性检验(family-based association test,FBAT)软件分析这两个多态位点的基因型及其单体型与鼻咽癌易感性的关联.结果 FBAT软件分析结果 显示,位点m1和m2的微效等位基因频率(MAF)分别为0.442(C)和0.339(G).其中无论是否根据EB病毒壳抗原抗体(VCA-IgA)分层,m1位点与鼻咽癌的易感性之间关联均无统计学意义[未分层:X2=2.399,P=0.301;分层后:低滴度组(VCA-IgA<1:80),MAF=0.457(C),X2=1.221,P=0.543;高滴度组(VCA-IgA≥1:80),MAF=0.427(C),X2=2.832,P=0.243];对m2位点来说,末根据VCA-IgA分层时,该位点与鼻咽癌的易感性之间关联无统计学意义(X2=2.694,P=0.260).分层后,在低滴度组,累加和显性模式下,位点m2等位基因G显示了从亲代到子代传递减少[MAF=0.347(G);Z<,累加>=-2.120

作者:徐亚菲;潘清华;崔璀;陈丽珍;冯启胜;曾益新;贾卫华

来源:中华预防医学杂志 2009 年 43卷 7期

知识库介绍

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作者:
徐亚菲;潘清华;崔璀;陈丽珍;冯启胜;曾益新;贾卫华
来源:
中华预防医学杂志 2009 年 43卷 7期
标签:
鼻咽肿瘤 细胞色素P450 CYP1A1 多态性,单核苷酸 统计学 Nasopharyngeal neoplasms Cytochrome P-450 CYPIAI Polymorphism,single nucleotide Statistics
目的 利用以核心家系为基础的关联研究探讨细胞色素P450酶系(cytochrome P450,CYP450)CYP1A1基因m1和m2多态性并分析其与鼻咽癌易感性的关联.方法 收集457个广东鼻咽癌核心家系(每个核心家系由患者和父母或同胞构成)共2134名成员作为研究对象,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法对CYPlAl基因单核苷酸多态性(SNP)位点m1和m2(其参考编号分别为rs4646903和rs1048943)进行基因分型.挑选PCR产物测序验证.运用家系为基础的相关性检验(family-based association test,FBAT)软件分析这两个多态位点的基因型及其单体型与鼻咽癌易感性的关联.结果 FBAT软件分析结果 显示,位点m1和m2的微效等位基因频率(MAF)分别为0.442(C)和0.339(G).其中无论是否根据EB病毒壳抗原抗体(VCA-IgA)分层,m1位点与鼻咽癌的易感性之间关联均无统计学意义[未分层:X2=2.399,P=0.301;分层后:低滴度组(VCA-IgA<1:80),MAF=0.457(C),X2=1.221,P=0.543;高滴度组(VCA-IgA≥1:80),MAF=0.427(C),X2=2.832,P=0.243];对m2位点来说,末根据VCA-IgA分层时,该位点与鼻咽癌的易感性之间关联无统计学意义(X2=2.694,P=0.260).分层后,在低滴度组,累加和显性模式下,位点m2等位基因G显示了从亲代到子代传递减少[MAF=0.347(G);Z<,累加>=-2.120