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目的 探讨采用同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术的蛋白组学分析筛选增生性糖尿病视网膜病变(PDR)患者与玻璃体混浊患者玻璃体液之间差异表达蛋白的可行性,寻找PDR防治的新靶点.方法 实验研究.收集2016年9月至2017年11月在天津医科大学眼科医院就诊的PDR的患者28例,随机数字表法随机分为2个PDR组,每组14例;另将诊断为玻璃体混浊的患者4例作为对照组,随机分为2个对照组,每组2例.PDR患者与玻璃体混浊患者的平均年龄分别为52和64岁.将每组患者的样本混合后提取蛋白,行iTRAQ标记,根据液相质谱-串联质谱检测(LC-MS/MS)分析结果,行差异蛋白分析及相应蛋白基因本体论(GO)数据库功能富集及京都基因与基因组(KEGG)数据库通路图显著性富集分析.对玻璃体液蛋白谱的相对定量结果进行独立样本t检验,结合差异倍数(FC)和P值判定蛋白表达量变化.结果 根据不同患者的玻璃体液蛋白表达谱信息,发现其间共存在26个差异表达蛋白,PDR包括7个上调蛋白和19个下调蛋白,如视黄酸受体反应蛋白2(Chemerin)(PDR1组=85.0,PDR2组=83.0,对照1组=119.6,对照2组=120.2,FC=0.710,P=0.001)、轴突生长导向因子4B(Semaphorin 4B,Sema 4B)(PDR1组=64.4,PDR2组=68.8,对照1组=135.4,对照2组=146.0,FC=0.473,P=0.023)、载脂蛋白B(Apolipoprotein,

作者:温德佳;任新军;东莉洁;何叶;李筱荣

来源:中华眼科杂志 2019 年 55卷 10期

知识库介绍

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作者:
温德佳;任新军;东莉洁;何叶;李筱荣
来源:
中华眼科杂志 2019 年 55卷 10期
标签:
糖尿病视网膜病变 蛋白质组学 玻璃体 色谱法,液相 串联质谱法 Diabetic retinopathy Proteomics Vitreous body Chromatography liquid Tandem mass spectrometry
目的 探讨采用同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术的蛋白组学分析筛选增生性糖尿病视网膜病变(PDR)患者与玻璃体混浊患者玻璃体液之间差异表达蛋白的可行性,寻找PDR防治的新靶点.方法 实验研究.收集2016年9月至2017年11月在天津医科大学眼科医院就诊的PDR的患者28例,随机数字表法随机分为2个PDR组,每组14例;另将诊断为玻璃体混浊的患者4例作为对照组,随机分为2个对照组,每组2例.PDR患者与玻璃体混浊患者的平均年龄分别为52和64岁.将每组患者的样本混合后提取蛋白,行iTRAQ标记,根据液相质谱-串联质谱检测(LC-MS/MS)分析结果,行差异蛋白分析及相应蛋白基因本体论(GO)数据库功能富集及京都基因与基因组(KEGG)数据库通路图显著性富集分析.对玻璃体液蛋白谱的相对定量结果进行独立样本t检验,结合差异倍数(FC)和P值判定蛋白表达量变化.结果 根据不同患者的玻璃体液蛋白表达谱信息,发现其间共存在26个差异表达蛋白,PDR包括7个上调蛋白和19个下调蛋白,如视黄酸受体反应蛋白2(Chemerin)(PDR1组=85.0,PDR2组=83.0,对照1组=119.6,对照2组=120.2,FC=0.710,P=0.001)、轴突生长导向因子4B(Semaphorin 4B,Sema 4B)(PDR1组=64.4,PDR2组=68.8,对照1组=135.4,对照2组=146.0,FC=0.473,P=0.023)、载脂蛋白B(Apolipoprotein,