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目的:研究INS-1-3细胞(大鼠胰岛素高分泌细胞亚系)经毒胡萝卜素和衣霉素处理后造成内质网应激的基因表达谱变化。方法以正常培养的INS-1-3细胞为对照组,通过毒胡萝卜素( TG组,0.1μmol/L,16 h)和衣霉素( TM组,2.5μg/ml,16 h)建立内质网应激模型,收集样本进行数字基因表达谱分析,筛选差异表达基因并进行差异基因表达模式聚类分析,基因本体论( GO)功能和pathway富集分析,并通过定量PCR对部分差异表达基因进行验证。结果 TG组和TM组分别与对照组比较,筛选出的差异基因数目分别为57个(其中上调基因45个,下调基因12个)和135个(其中上调基因99个,下调基因36个)。 GO功能显著性富集分析显示,细胞组分主要富集在内质网区域。pathway富集分析显示,共同显著富集的途径包括内质网应激、抗原的加工与提呈、蛋白运输和青少年发病的成人型糖尿病(MODY)通路。结论内质网应激的情况下,MODY信号通路相关转录因子表达发生变化可能与胰岛β细胞功能发生改变有关。

作者:刘瑜婷;李世蕊;王在;肖建中

来源:中华医学杂志 2016 年 96卷 34期

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作者:
刘瑜婷;李世蕊;王在;肖建中
来源:
中华医学杂志 2016 年 96卷 34期
标签:
毒胡萝卜素 衣霉素 胰岛细胞 基因表达谱 内质网应激 Thapsigargin Tunicamycin Islet cell Gene expression profiling Endoplasmic reticulum stress
目的:研究INS-1-3细胞(大鼠胰岛素高分泌细胞亚系)经毒胡萝卜素和衣霉素处理后造成内质网应激的基因表达谱变化。方法以正常培养的INS-1-3细胞为对照组,通过毒胡萝卜素( TG组,0.1μmol/L,16 h)和衣霉素( TM组,2.5μg/ml,16 h)建立内质网应激模型,收集样本进行数字基因表达谱分析,筛选差异表达基因并进行差异基因表达模式聚类分析,基因本体论( GO)功能和pathway富集分析,并通过定量PCR对部分差异表达基因进行验证。结果 TG组和TM组分别与对照组比较,筛选出的差异基因数目分别为57个(其中上调基因45个,下调基因12个)和135个(其中上调基因99个,下调基因36个)。 GO功能显著性富集分析显示,细胞组分主要富集在内质网区域。pathway富集分析显示,共同显著富集的途径包括内质网应激、抗原的加工与提呈、蛋白运输和青少年发病的成人型糖尿病(MODY)通路。结论内质网应激的情况下,MODY信号通路相关转录因子表达发生变化可能与胰岛β细胞功能发生改变有关。