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目的 探讨结直肠癌患者癌组织定植菌群结构和组分变化,分析肠道定植菌群与结直肠癌发生发展的关系.方法 回顾性研究.收集2016年1月至2017年10月同济大学附属同济医院院行胃肠外科手术的乙状结肠28份位置匹配的组织样本为结直肠癌组,同期收集12份健康体检者正常肠黏膜组织样本为对照组.采用Illumina Miseq测序技术进行细菌16S rRNA基因V3-V4区测序,分析并比较正常肠黏膜组织和癌组织定植菌群结构与组分差异.统计学方法采用Mann-Whitney检验.结果 正常肠黏膜组织与癌组织定植菌群的结构存在显著差异.在门水平,厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)在癌组织中的丰度显著偏低(Z=-1.964,P<0.01),而变形菌门(Proteobacteria)在癌组织中的丰度则显著偏高(Z=-1.997,P<0.01);在属水平,拟杆菌属(Bacteroides)、布劳特菌属(Blautia)、普雷沃菌属(Prevotella)和普拉梭菌(Faecalibacteriu)等在癌组织中的丰度明显低于正常肠黏膜组织(Z=-3.008,P<0.05);仅在正常肠黏膜组织定植且丰度排前3位是布赫纳什菌属(Buchnera)、普氏菌属(Prevotella)和普雷沃菌科(Prevotellaceae),仅在癌组织定植且丰度排前3位是卡氏菌属(Catonella)、库特菌属(Kurthia)和短单胞菌属(Brachymonas).结论 通过鉴定肠黏膜组织定植菌群

作者:徐蓉;孙祖俊;商安全;吴军录;李冬

来源:中华检验医学杂志 2019 年 42卷 1期

知识库介绍

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作者:
徐蓉;孙祖俊;商安全;吴军录;李冬
来源:
中华检验医学杂志 2019 年 42卷 1期
标签:
结直肠肿瘤 肠黏膜 胃肠道微生物组 高通量核苷酸序列分析 生物标记,肿瘤 Colorectal neoplasms Intestinal mucosa Gastrointestinal microbiome High-throughput nucleotide sequencing Biomarkers,tumor
目的 探讨结直肠癌患者癌组织定植菌群结构和组分变化,分析肠道定植菌群与结直肠癌发生发展的关系.方法 回顾性研究.收集2016年1月至2017年10月同济大学附属同济医院院行胃肠外科手术的乙状结肠28份位置匹配的组织样本为结直肠癌组,同期收集12份健康体检者正常肠黏膜组织样本为对照组.采用Illumina Miseq测序技术进行细菌16S rRNA基因V3-V4区测序,分析并比较正常肠黏膜组织和癌组织定植菌群结构与组分差异.统计学方法采用Mann-Whitney检验.结果 正常肠黏膜组织与癌组织定植菌群的结构存在显著差异.在门水平,厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)在癌组织中的丰度显著偏低(Z=-1.964,P<0.01),而变形菌门(Proteobacteria)在癌组织中的丰度则显著偏高(Z=-1.997,P<0.01);在属水平,拟杆菌属(Bacteroides)、布劳特菌属(Blautia)、普雷沃菌属(Prevotella)和普拉梭菌(Faecalibacteriu)等在癌组织中的丰度明显低于正常肠黏膜组织(Z=-3.008,P<0.05);仅在正常肠黏膜组织定植且丰度排前3位是布赫纳什菌属(Buchnera)、普氏菌属(Prevotella)和普雷沃菌科(Prevotellaceae),仅在癌组织定植且丰度排前3位是卡氏菌属(Catonella)、库特菌属(Kurthia)和短单胞菌属(Brachymonas).结论 通过鉴定肠黏膜组织定植菌群