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目的:探讨单核苷酸多态性微阵列(single nucleotide polymorphism array,SNP array)在Angelman 综合征(Angelman syndrome,AS)基因型与表型对应分析中的应用。方法对1例临床表现为先天畸形、智力低下、发育迟缓等异常的患儿及其父母行外周血染色体核型分析和 SNP array 检测,同时用基于 SNP 信号的孟德尔遗传错误校验进行家系传递分析,之后用荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)检测验证 SNP array 结果。结果患儿 SNP array 结果显示15q11.2q13.1(22770421~28823722)存在6.053 Mb 缺失,与1型缺失型 AS 关键区域完全重叠。患儿父母染色体核型、SNP array 及 FISH 检测结果均未见异常,表明15q11.2q13.1缺失为新发的变异。家系孟德尔遗传错误校验结果提示患儿15q11.2q13.1缺失为母源性片段缺失。结论SNP array 可以精确地分析15q11q13缺失片段的大小、断裂点及其亲源性,从而有效地诊断缺失型 AS,促进 AS 基因型与表型的对应关系分析。

作者:史珊珊;林少宾;廖燕芬;李玮璟

来源:中华医学遗传学杂志 2016 年 33卷 6期

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作者:
史珊珊;林少宾;廖燕芬;李玮璟
来源:
中华医学遗传学杂志 2016 年 33卷 6期
标签:
Angelman综合征 缺失 单核苷酸多态性微阵列 基因型 表型 Angelman syndrome Deletion Single nucleotide polymorphism array Genotype Phenotype
目的:探讨单核苷酸多态性微阵列(single nucleotide polymorphism array,SNP array)在Angelman 综合征(Angelman syndrome,AS)基因型与表型对应分析中的应用。方法对1例临床表现为先天畸形、智力低下、发育迟缓等异常的患儿及其父母行外周血染色体核型分析和 SNP array 检测,同时用基于 SNP 信号的孟德尔遗传错误校验进行家系传递分析,之后用荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)检测验证 SNP array 结果。结果患儿 SNP array 结果显示15q11.2q13.1(22770421~28823722)存在6.053 Mb 缺失,与1型缺失型 AS 关键区域完全重叠。患儿父母染色体核型、SNP array 及 FISH 检测结果均未见异常,表明15q11.2q13.1缺失为新发的变异。家系孟德尔遗传错误校验结果提示患儿15q11.2q13.1缺失为母源性片段缺失。结论SNP array 可以精确地分析15q11q13缺失片段的大小、断裂点及其亲源性,从而有效地诊断缺失型 AS,促进 AS 基因型与表型的对应关系分析。