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目的:分析泛耐药肺炎克雷伯菌JM45株携带的喹诺酮类药物耐药基因,研究其对喹诺酮类药物的耐药机制。方法采用Roche454高通量测序技术对肺炎克雷伯菌JM 45株做全基因组测序(完成图),分析喹诺酮类耐药基因携带状况,再将 gy rA与p arC全长基因与其他6株肺炎克雷伯菌做分子进化分析。结果最终得到JM 45株一条完整的基因组(染色体)序列及两条质粒序列;基因组(染色体)序列大小为5273812 bp (GC含量65.8%),质粒1序列大小为317156 bp(GC含量53.0%),质粒2序列大小为12209 bp(GC含量55.3%);在基因组(染色体)序列中携带了 gyrA基因(全基因组Feature ID :KPN_1614),parC基因(Feature ID :KPN_0743);与肺炎克雷伯菌喹诺酮类药物敏感株相比较,gyrA基因第83位密码子由 TCC→ATC ,翻译成氨基酸序列后丝氨酸(Ser)→异亮氨酸(Ile),parC基因第80位密码子由AGC→ATC ,翻译成氨基酸序列后丝氨酸(Ser)→异亮氨酸(Ile)。结论肺炎克雷伯菌 JM45株喹诺酮类药物耐药是 gyrA 基因和 parC 基因喹诺酮耐药决定区(QRDR)突变所致;gyrA与 parC全长基因的分子进化分析提示JM45株与肺炎克雷伯菌 HS11286关系最为接近(序列相同),与肺炎克雷伯菌342关系最远。

作者:朱健铭;姜如金;吴康乐;翁幸鐾;孔海深

来源:中华医院感染学杂志 2014 年 10期

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作者:
朱健铭;姜如金;吴康乐;翁幸鐾;孔海深
来源:
中华医院感染学杂志 2014 年 10期
标签:
肺炎克雷伯菌 泛耐药 全基因组测序 完成图 喹诺酮类 K lebsiella pneumoniae Pandrug-resistance Whole genome sequencing Completed graph Quinolone
目的:分析泛耐药肺炎克雷伯菌JM45株携带的喹诺酮类药物耐药基因,研究其对喹诺酮类药物的耐药机制。方法采用Roche454高通量测序技术对肺炎克雷伯菌JM 45株做全基因组测序(完成图),分析喹诺酮类耐药基因携带状况,再将 gy rA与p arC全长基因与其他6株肺炎克雷伯菌做分子进化分析。结果最终得到JM 45株一条完整的基因组(染色体)序列及两条质粒序列;基因组(染色体)序列大小为5273812 bp (GC含量65.8%),质粒1序列大小为317156 bp(GC含量53.0%),质粒2序列大小为12209 bp(GC含量55.3%);在基因组(染色体)序列中携带了 gyrA基因(全基因组Feature ID :KPN_1614),parC基因(Feature ID :KPN_0743);与肺炎克雷伯菌喹诺酮类药物敏感株相比较,gyrA基因第83位密码子由 TCC→ATC ,翻译成氨基酸序列后丝氨酸(Ser)→异亮氨酸(Ile),parC基因第80位密码子由AGC→ATC ,翻译成氨基酸序列后丝氨酸(Ser)→异亮氨酸(Ile)。结论肺炎克雷伯菌 JM45株喹诺酮类药物耐药是 gyrA 基因和 parC 基因喹诺酮耐药决定区(QRDR)突变所致;gyrA与 parC全长基因的分子进化分析提示JM45株与肺炎克雷伯菌 HS11286关系最为接近(序列相同),与肺炎克雷伯菌342关系最远。