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目的 探讨宏基因二代测序技术对厌氧菌感染精准化诊断的临床价值.方法 回顾性分析2017年2月-2019年2月复旦大学附属中山医院感染病科收治的16例临床诊断为厌氧菌感染患者的资料.描述其临床特点、比较宏基因二代测序与培养检测外周血、组织匀浆、脓液、灌洗液及无菌体液等标本厌氧菌的阳性率与时间,以阐明宏基因二代基因技术在厌氧菌诊断方面的优势.结果 符合入组条件的厌氧菌感染患者共16例.厌氧菌感染部位包括:肺部(8例)、皮肤软组织(2例)、腹腔(1例)、混合部位感染(5例).同时送厌氧菌培养及宏基因二代测序的微生物标本共29份,标本类型包括:外周血(3份)、组织匀浆(5份)、脓液(11份)、灌洗液(8份)和无菌部位体液(2份).培养阳性率为20.67% (6/29),宏基因二代测序的阳性率为82.76% (24/29),后者高于前者(P<0.01).按感染部位分层,肺部感染的标本中宏基因二代测序病原体检出的阳性率为71.43% (10/14)高于培养阳性率7.14% (1/14)(P<0.01);按标本类型分层,发现两种方法检测组织匀浆、脓液和灌洗液时宏基因二代测序的阳性率分别为80.00% (4/5)、100.O0% (11/11)和62.50% (5/8),均高于培养阳性率(P<0.05).二代测序的平均检测时间为(39.66±15.09)h短与培养(81 21±37.94)h(P<0.01).结论 宏基因二代测

作者:李冰;缪青;金文婷;黄英男;潘珏;胡必杰

来源:中华医院感染学杂志 2019 年 29卷 13期

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李冰;缪青;金文婷;黄英男;潘珏;胡必杰
来源:
中华医院感染学杂志 2019 年 29卷 13期
标签:
宏基因二代测序 培养 厌氧菌感染 诊断
目的 探讨宏基因二代测序技术对厌氧菌感染精准化诊断的临床价值.方法 回顾性分析2017年2月-2019年2月复旦大学附属中山医院感染病科收治的16例临床诊断为厌氧菌感染患者的资料.描述其临床特点、比较宏基因二代测序与培养检测外周血、组织匀浆、脓液、灌洗液及无菌体液等标本厌氧菌的阳性率与时间,以阐明宏基因二代基因技术在厌氧菌诊断方面的优势.结果 符合入组条件的厌氧菌感染患者共16例.厌氧菌感染部位包括:肺部(8例)、皮肤软组织(2例)、腹腔(1例)、混合部位感染(5例).同时送厌氧菌培养及宏基因二代测序的微生物标本共29份,标本类型包括:外周血(3份)、组织匀浆(5份)、脓液(11份)、灌洗液(8份)和无菌部位体液(2份).培养阳性率为20.67% (6/29),宏基因二代测序的阳性率为82.76% (24/29),后者高于前者(P<0.01).按感染部位分层,肺部感染的标本中宏基因二代测序病原体检出的阳性率为71.43% (10/14)高于培养阳性率7.14% (1/14)(P<0.01);按标本类型分层,发现两种方法检测组织匀浆、脓液和灌洗液时宏基因二代测序的阳性率分别为80.00% (4/5)、100.O0% (11/11)和62.50% (5/8),均高于培养阳性率(P<0.05).二代测序的平均检测时间为(39.66±15.09)h短与培养(81 21±37.94)h(P<0.01).结论 宏基因二代测