目的 采用生物信息学方法分析miR-486-3p靶基因在甲状腺乳头状癌(PTC)中的差异表达情况及临床意义.方法 根据肿瘤基因图谱中PTC肿瘤样本及配对样本的表达数据筛选miR-486-3p差异表达基因,使用ClusterProfiler R包对差异表达基因进行GO和KEGG注释,ggplot2 R包绘制GO二级分类柱形图及KEGG注释统计图,将预测miR-486-3p靶基因并与差异表达基因取交集,采用Survival R包对样本进行生存分析,绘制Kaplan-Meier生存曲线.结果 共筛选出99个差异表达基因,其中74个基因上调,25个基因下调,差异表达的基因多与细胞组织结构、形态发育、ERK1/2通路等功能调控相关,主要涉及病毒感染、细胞周期、泛素化、蛋白水解、p53信号通路、细胞衰老等通路.miR-486-3p低表达的PTC患者总生存率低于高表达的患者(P<0.05).结论 miR-486-3p可在PTC中参与调节肿瘤细胞的生物学功能,且低表达miR-486-3p的PTC患者预后不良,提示miR-486-3p或作为抑癌基因及生物标志物在PTC发生、发展中起重要作用.
作者：赵晓海；王成志；孔建兵；鲍跃兵；邱永伟；赖瑞南
来源：浙江医学 2020 年 42卷 20期
