您的账号已在其他设备登录,您当前账号已强迫下线,
如非您本人操作,建议您在会员中心进行密码修改

确定
收藏 | 浏览255 | 下载0

[目的]对肿瘤相关hsa-miR-95-3p进行靶基因的预测及功能分析,为肿瘤发生的分子机制提供理论依据.[方法]选择miranda、TargetScan、RNAhybrid3种软件预测其靶基因,选择已经实验证实的靶基因作为进一步生物信息学分析的基因集合,对此基因集合进行功能富集分析(GO分析)、Pathway分析和蛋白互作分析.[结果]Hsa-miR-95-3p序列在各物种间高度保守.3个软件分别预测得到2118、1632和58个靶基因,鉴定得到实验验证的靶基因共114个,对这些靶基因进行GO和KEGG富集分析.这些靶基因主要富集于蛋白激酶反应、基因表达调控、细胞内信号传导、细胞分裂等生物学过程和功能上(P<0.05).信号通路富集分析显示富集于AMPK信号通路,mTOR信号通路,p53信号通路,核黄素代谢,肝细胞癌,非小细胞肺癌,甲状腺癌,RNA降解等通路(P<0.05).[结论]Hsa-miR-95-3p的靶基因主要与肿瘤细胞的增殖与分化即癌症发生的生物学过程相关,这为进一步实验研究提供了线索.

作者:杨立涛;杜义安;俞鹏飞;黄灵;王新保

来源:肿瘤学杂志 2016 年 22卷 5期

知识库介绍

临床诊疗知识库该平台旨在解决临床医护人员在学习、工作中对医学信息的需求,方便快速、便捷的获取实用的医学信息,辅助临床决策参考。该库包含疾病、药品、检查、指南规范、病例文献及循证文献等多种丰富权威的临床资源。

详细介绍
热门关注
免责声明:本知识库提供的有关内容等信息仅供学习参考,不代替医生的诊断和医嘱。

收藏
| 浏览:255 | 下载:0
作者:
杨立涛;杜义安;俞鹏飞;黄灵;王新保
来源:
肿瘤学杂志 2016 年 22卷 5期
标签:
hsa-miR-95-3p 肿瘤 生物信息学 靶基因 hsa-miR-95-3p neoplasms bioinformatics analysis target gene
[目的]对肿瘤相关hsa-miR-95-3p进行靶基因的预测及功能分析,为肿瘤发生的分子机制提供理论依据.[方法]选择miranda、TargetScan、RNAhybrid3种软件预测其靶基因,选择已经实验证实的靶基因作为进一步生物信息学分析的基因集合,对此基因集合进行功能富集分析(GO分析)、Pathway分析和蛋白互作分析.[结果]Hsa-miR-95-3p序列在各物种间高度保守.3个软件分别预测得到2118、1632和58个靶基因,鉴定得到实验验证的靶基因共114个,对这些靶基因进行GO和KEGG富集分析.这些靶基因主要富集于蛋白激酶反应、基因表达调控、细胞内信号传导、细胞分裂等生物学过程和功能上(P<0.05).信号通路富集分析显示富集于AMPK信号通路,mTOR信号通路,p53信号通路,核黄素代谢,肝细胞癌,非小细胞肺癌,甲状腺癌,RNA降解等通路(P<0.05).[结论]Hsa-miR-95-3p的靶基因主要与肿瘤细胞的增殖与分化即癌症发生的生物学过程相关,这为进一步实验研究提供了线索.