利用1 090 071个SNP标记,对419份广西地方稻种资源核心种质的糯性进行全基因组关联分析.结果表明,运用混合线性模型,在P<4.72x10-8 (4.72E-8)水平下,检测到45个与糯性显著关联的SNP位点,均位于第6号染色体上.通过筛选显著关联位点上、下游各150 kb区域内的基因,共找到305个候选基因,其中包含2个与淀粉合成酶相关的Wx和SSⅡa基因;同时在第6号染色体5.69-5.89 Mb区域发现4个与糯性显著关联的SNP位点,该区域可能是影响水稻(Oryza sativa)糯性的重要候选区域.
作者:杨行海;农保选;夏秀忠;张宗琼;曾宇;刘开强;邓国富;李丹婷
来源:植物学报 2016 年 51卷 6期