根据已构建苦瓜果实均一化文库中获得的1个与β-Gal基因相关的EST序列,采用经3′RACE技术,克隆获得1个苦瓜β-Gal基因的cDNA序列McGAL,全长为2261 bp,开放阅读框2160 bp,编码719个氨基酸.该基因在GenBank基因数据库的登录号为AFD54987.1.应用生物信息学软件对McGAL氨基酸序列分析表明,McGAL含有糖苷水解酶家族35的保守结构域G-G-P-[LIVM]-x-Q-x-E-N-E-[FY],C端不含凝集素结构域.二级结构显示,该酶含有α-螺旋(19.89%)、伸展链(26.98%)、β-转角(6.54%)和无规卷曲(46.59%).McGAL氨基酸序列与鹰嘴豆、苜蓿、绿豆、大豆、羽扇豆的氨基酸序列的同源性分别达到73%、73%、73%、72%和71%.亚细胞定位结果表明,McGAL定位在线粒体膜上.荧光定量结果表明,Mc-GAL在果实绿熟期表达量最高并随之下降,该基因可能与果实成熟软化初期相关.
作者:高山;陈桂信;许端祥;林碧英;林义章;潘东明
来源:植物遗传资源学报 2013 年 14卷 6期