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辣椒(Capsicum annuum L.)是一种重要的蔬菜作物,分析辣椒种质的遗传多样性对于辣椒种质的收集、鉴定和利用都有重要的意义.EST-SSR标记是一种位于转录区的SSR标记,能够检测出转录区的多态性,进而能够反映出种质之间真实的遗传多样性.本研究利用33个EST-SSR标记分析了31份辣椒种质的遗传多样性.EST-SSR标记在测试的辣椒种质上共检测出91个等位基因,平均每个位点扩增出2.76个等位基因,最多扩增出6个等位基因,多态性信息含量(PIC)最小为0.03,最大为0.74,平均为0.38.系统聚类分析将31份种质分为2大类,聚类结果表现出了一定程度的与果实性状的相关性.主坐标分析的结果基本上与聚类分析的结果一致,但更加详细地表现了辣椒种质之间的遗传变异.

作者:陈文超;张竹青;邹学校

来源:植物遗传资源学报 2013 年 14卷 6期

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作者:
陈文超;张竹青;邹学校
来源:
植物遗传资源学报 2013 年 14卷 6期
标签:
辣椒 遗传多样性 EST-SSR 聚类分析 主坐标分析 Pepper genetic diversity EST-SSR systemic cluster analysis principal coordinate analysis
辣椒(Capsicum annuum L.)是一种重要的蔬菜作物,分析辣椒种质的遗传多样性对于辣椒种质的收集、鉴定和利用都有重要的意义.EST-SSR标记是一种位于转录区的SSR标记,能够检测出转录区的多态性,进而能够反映出种质之间真实的遗传多样性.本研究利用33个EST-SSR标记分析了31份辣椒种质的遗传多样性.EST-SSR标记在测试的辣椒种质上共检测出91个等位基因,平均每个位点扩增出2.76个等位基因,最多扩增出6个等位基因,多态性信息含量(PIC)最小为0.03,最大为0.74,平均为0.38.系统聚类分析将31份种质分为2大类,聚类结果表现出了一定程度的与果实性状的相关性.主坐标分析的结果基本上与聚类分析的结果一致,但更加详细地表现了辣椒种质之间的遗传变异.