目的 筛选在慢性心力衰竭中差异表达的microRNA(miRNA),并对其靶基因进行生物信息学分析,以期为miRNA调控慢性心力衰竭机制的相关性研究奠定基础.方法 利用GEO数据库及limma软件包筛选出在慢性心力衰竭中差异表达的miRNA,进而应用Targetscan、miRPathDB数据库通过生物信息学方法预测其靶基因,最后利用CytoScape软件及David数据库对靶基因进行GO富集及生物通路富集分析.结果 miR-197在慢性心力衰竭中差异表达,其靶基因富集在生物调控、基因表达等生物学过程中,细胞质膜、细胞核等细胞组分上,以及离子结合、核苷酸结合等分子功能中.生物信号通路则显著富集在Ras、Rap1、Wnt、Hippo等信号通路中.结论 miR-197或许是调控慢性心力衰竭疾病进程的潜在作用靶点.
作者:王庆高;何亚州;李丽娟;黄彩依;黄景伟;梁珊
来源:中西医结合心脑血管病杂志 2020 年 18卷 5期