目的 运用网络药理学研究方法探讨交泰丸治疗失眠症的作用机制.方法 应用中药药理学平台TCMSP数据库和Batman数据库筛选交泰丸的成分和相关靶点,使用Uniprot数据库,将靶点名称进行矫正统一,并使用Swiss Target Prediction数据库对靶点信息进行补充;并通过Gene Cards数据库以"失眠"为关键词进行检索,获得疾病作用靶点;在Venny 2.1在线软件作图工具平台上分别录入黄连、肉桂与失眠症的靶点,绘制韦恩图,得到药物与疾病的共同靶点;使用Cytoscape 3.7.1软件,构建"药物-成分-疾病-靶点"相互作用网络图,使用Network Analyzer功能对中药复方的主要活性成分进行分析;将共同靶点输入到STRING数据库中进行检索,构建蛋白相互作用关系(PPI)网络,并根据蛋白之间的关联度进行排序;在R软件安装Bioconductor软件包"org.Hs.eg.db",将药物-疾病共同靶点转换成entrezID,然后在R软件安装"clusterProfiler"包,根据已转换的entrezID,以P<0.05,Q<0.05进行关键靶基因的基因本体论(GO)与京都基因和基因组百科全书(KEGG)功能富集分析.结果 筛选出交泰丸34个有效成分和498个药物靶点,失眠疾病靶点2279个;通过韦恩图取交集后获得药物-疾病共同靶点160个,筛选出黄连-肉桂与失眠症共同靶点基因21个;这些共同靶点涉及第二信使介导的信号传
作者:洪曹栋;尹嘉;张萌;门九章;冯明
来源:中西医结合心脑血管病杂志 2020 年 18卷 10期