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目的:通过网络药理学方法和分子对接技术研究真武汤治疗扩张型心肌病(Dilated Cardiomyopathy,DCM)的作用及其机制.方法:使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCSMP)等数据库精选真武汤中药材的主要活性成分和功能靶点,再利用GeneCards、OMIM等数据库获取DCM的关键靶点,进而筛选出其共同作用靶点.并利用Cytoscape 3.8.2软件来建立"真武汤-有效成分-DCM-靶点"网络图.并通过String数据库获得蛋白质-蛋白质相互作用的网络,从而筛选出了关键基因.利用DAVID数据库对关键靶点做了基因本体论(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.利用RCSB PDB、PubChem数据库,利用ChemBio3D、PyMOL以及AutoDock pyrx内部的Vina软件工具做分子对接,最后使用DS2019软件作图.结果:共得到真武汤中药物主要活性成分59个、重要交集靶点38个,GO富集功能分析显示条目628个,KEGG富集通路126个.真武汤主要活性成分包括β-谷甾醇、山柰酚、常春藤皂苷元等;关键靶点有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、一氧化氮合酶3(Nitric Oxide Synthase 3,NOS3)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(Peroxisome Proliferator Activated Receptor Gamma,PPARG)等;主要涉及癌症途径、脂质与动脉粥样硬化、糖

作者:李明阳;曹海明;李峥;李文杰

来源:中医临床研究 2023 年 15卷 7期

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作者:
李明阳;曹海明;李峥;李文杰
来源:
中医临床研究 2023 年 15卷 7期
标签:
真武汤 扩张型心肌病 网络药理学 分子对接 细胞凋亡
目的:通过网络药理学方法和分子对接技术研究真武汤治疗扩张型心肌病(Dilated Cardiomyopathy,DCM)的作用及其机制.方法:使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCSMP)等数据库精选真武汤中药材的主要活性成分和功能靶点,再利用GeneCards、OMIM等数据库获取DCM的关键靶点,进而筛选出其共同作用靶点.并利用Cytoscape 3.8.2软件来建立"真武汤-有效成分-DCM-靶点"网络图.并通过String数据库获得蛋白质-蛋白质相互作用的网络,从而筛选出了关键基因.利用DAVID数据库对关键靶点做了基因本体论(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.利用RCSB PDB、PubChem数据库,利用ChemBio3D、PyMOL以及AutoDock pyrx内部的Vina软件工具做分子对接,最后使用DS2019软件作图.结果:共得到真武汤中药物主要活性成分59个、重要交集靶点38个,GO富集功能分析显示条目628个,KEGG富集通路126个.真武汤主要活性成分包括β-谷甾醇、山柰酚、常春藤皂苷元等;关键靶点有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、一氧化氮合酶3(Nitric Oxide Synthase 3,NOS3)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(Peroxisome Proliferator Activated Receptor Gamma,PPARG)等;主要涉及癌症途径、脂质与动脉粥样硬化、糖