目的 对阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)患者血液相关内源性竞争RNA(Competing endogenous RNAs,ceRNA)网络综合分析,寻找诊断治疗的新方向.方法 从基因表达综合数据库(Gene ex-pression omnibus,GEO)下载AD患者血液相关芯片数据,对数据进行整理并筛选差异表达的长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)及信使RNA(Messenger RNA,mRNA)基因;利用miRcode,Tar-getScan,miRTarBase和miRDB数据库对lncRNA和微小RNA(MicroRNA,miRNA)进行预测并取对应数据的交集来构建ceRNA网络;使用Cytoscape的cytoHubba插件筛选ceRNA网络关键lncRNA;通过临床数据计算各关键LncRNA的AUC值来评估各关键LncRNA的诊断性能;使用STRING构建蛋白-蛋白相互作用(Protein-protein interaction,PPI)网络,再使用MCODE插件筛选关键基因模块;利用DAVID数据库对关键模块中的基因进行基因本体论(Gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路分析.结果 共筛选出9个关键lncRNA[X染色体失活特异转录因子(X in-active specific transcription factor,XIST)、RNA聚合酶2亚基J4(RNA polymeraseⅡsubunit J4,POLR2J4)、多聚胞嘧啶结合蛋白1反义RNA1(Poly C binding protein-1 antisense
作者:张亚恒;魏冕;于亚亮;吕建周;安惠娟;王志涛;余晓斐;韩亚;马丹;徐品丽
来源:卒中与神经疾病 2021 年 28卷 4期