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目的 研究西南地区人乳头瘤病毒6型(HPV-6)和11型(HPV-11) E6/E7基因多态性,为低危型HPV的防治提供分子水平.方法 对HPV-6和HPV-11阳性标本扩增其目的基因,测序并对比Genenbank参考序列,对变异初步分析;PAML 4.8软件作用于E6/E7基因的选择压力.结果 HPV-6 E6/E7基因共12个突变位点,其中有3个是首次发现的突变位点,5/12为非同义突变;HPV-11 E6/E7中,共计5个单核苷酸突变,具有2/5非同义和3/5同义突变.选择压力结果显示,只有HPV-6 E7基因有3个正向选择位点,分别是4R**,34E*和52F**.结论 HPV-6 E6和E7序列在分析的群组中高度保守,表示HPV-6在进化的过程中,形成了有利于生存的分离株.HPV-11突变未发现正向选择位点,表明选择的变异对HPV-11来说适应环境较困难.

作者:万秋伶;丁显平;高鹏;方莅媛

来源:成都医学院学报 2019 年 14卷 2期

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作者:
万秋伶;丁显平;高鹏;方莅媛
来源:
成都医学院学报 2019 年 14卷 2期
标签:
人乳头瘤病毒6型 人乳头瘤病毒11型 基因多态性 低危型 选择压力
目的 研究西南地区人乳头瘤病毒6型(HPV-6)和11型(HPV-11) E6/E7基因多态性,为低危型HPV的防治提供分子水平.方法 对HPV-6和HPV-11阳性标本扩增其目的基因,测序并对比Genenbank参考序列,对变异初步分析;PAML 4.8软件作用于E6/E7基因的选择压力.结果 HPV-6 E6/E7基因共12个突变位点,其中有3个是首次发现的突变位点,5/12为非同义突变;HPV-11 E6/E7中,共计5个单核苷酸突变,具有2/5非同义和3/5同义突变.选择压力结果显示,只有HPV-6 E7基因有3个正向选择位点,分别是4R**,34E*和52F**.结论 HPV-6 E6和E7序列在分析的群组中高度保守,表示HPV-6在进化的过程中,形成了有利于生存的分离株.HPV-11突变未发现正向选择位点,表明选择的变异对HPV-11来说适应环境较困难.