目的 了解北京市西城区2015年手足口病(HFMD)患儿肠道病毒71型(EV 71)分离株VP1区基因特征,分析其变异情况.方法 收集北京市西城区2015年HFMD病原学检测分型鉴定为EV 71的阳性标本,对部分标本进行病毒分离、培养,并通过实时荧光PCR鉴定阳性培养物.EV 71阳性培养物提取病毒核酸,对其VP1区全长序列进行PCR扩增和测序.从Genbank中选取EV 71不同基因型别参考序列,利用生物信息学软件进行同源性和系统进化分析.结果 共分离到6株EV 71(Genbank登录号为KU376383-KU376388),其VP1区核苷酸和氨基酸序列同源性分别为93.00％～99.00％和98.00％～100.00％,与参考序列VP1区核苷酸和氨基酸序列同源性分别为81.00％ ～ 97.00％和93.00％ ～ 100.00％.进化分析显示,6株EV 71均为C4a基因亚型.结论 2015年北京市西城区EV 71流行株属于C4a亚型,未出现明显变异.
作者：吉彦莉；杨青俊；王永全；崔海洋；靳博；胡三梅；孔庆征
来源：公共卫生与预防医学 2016 年 27卷 2期
