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目的 解析肺癌敏感基因和基因间异常关系.方法 通过比较肺癌样本和对照样本,寻找肺癌细胞中出现的差异表达的基因和差异共表达基因对,将差异表达基因映射到差异共表达网络中,运用网络中节点重要性的度、脆弱性、介数和接近中心性进行排序,筛选肺癌敏感基因.结果 共挖掘得到15个具有重要作用的肺癌相关基因,其中有1 3个基因在肺癌表达谱中存在差异表达.另外,基因CCL19和TNFSF 13B虽然不存在表达差异性,但是它们的微小改变能够直接影响着其他基因的显著改变.结论 本文在差异表达和共表达研究基础上挖掘得到的新基因对于肺癌机制研究是重要的补充,而且发现了某些基因的微小改变可引起其他基因表达异常,这为进一步了解肺癌发生发展机制奠定了基础.

作者:陈传庚;段斌;廖高明;闻懿;常志强

来源:国际遗传学杂志 2015 年 38卷 1期

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作者:
陈传庚;段斌;廖高明;闻懿;常志强
来源:
国际遗传学杂志 2015 年 38卷 1期
标签:
差异共表达 差异表达 易感基因 Differential co-expression Differential expression Sensitive gene
目的 解析肺癌敏感基因和基因间异常关系.方法 通过比较肺癌样本和对照样本,寻找肺癌细胞中出现的差异表达的基因和差异共表达基因对,将差异表达基因映射到差异共表达网络中,运用网络中节点重要性的度、脆弱性、介数和接近中心性进行排序,筛选肺癌敏感基因.结果 共挖掘得到15个具有重要作用的肺癌相关基因,其中有1 3个基因在肺癌表达谱中存在差异表达.另外,基因CCL19和TNFSF 13B虽然不存在表达差异性,但是它们的微小改变能够直接影响着其他基因的显著改变.结论 本文在差异表达和共表达研究基础上挖掘得到的新基因对于肺癌机制研究是重要的补充,而且发现了某些基因的微小改变可引起其他基因表达异常,这为进一步了解肺癌发生发展机制奠定了基础.