目的 采用基因集富集分析(GSEA)方法寻找胃癌抵抗顺铂的免疫标记基因(ISGs).方法 用GEO数据库的GSE94714数据集,GEO2R分析差异基因,观察条件筛选对基因数的作用,GSEA纳入耐药、未耐药组胃癌细胞的全部差异表达基因,与分子标签数据库比较,获取ISGs,交集筛选,Kaplan Meier Plotter分析交集基因对胃癌预后的影响.结果 差异表达基因共34 183个,其中上调12 452个、下调17 381个,筛选差异倍数的增加使排除基因数增加.GSEA富集到标准化富集评分(NES)排序前6的条目(P＜0.01),其中的交集基因包括线粒体核糖体蛋白L12、富含脯氨酸蛋白13、毛状蛋白样F-肌动蛋白结合蛋白1、聚(RC)结合蛋白1、艾杜糖2-硫酸酯酶、LIM结构域2、富含嘌呤元素结合蛋白A、小视觉叶同源物、CCR 4-非转录复合物亚单位3、转化生长因子β1、二酰甘油激酶ζ、接头蛋白2,12个基因与胃癌的总生存时间有关,均具有统计学意义(P＜0.05).结论 GSEA方法可有效获取胃癌顺铂抵抗的ISGs,新发现的基因作为潜在靶点,可促进胃癌化疗抵抗机制的研究.
作者：汪圣毅；程彦；李旭升；闫亚飞；张尚鑫；闫强；李永翔
来源：安徽医科大学学报 2020 年 55卷 2期
