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目的 分析顺铂耐药卵巢癌的差异表达基因和信号通路.方法 用美国国立信息中心NCBI的GEO数据库获得顺铂耐药卵巢癌基因集GSE15372,通过R与Bioconductor软件进行差异表达基因分析;再利用DAVID在线工具对顺铂耐药卵巢癌差异表达基因进行GO本体分析、KEGG通路分析.结果 差异倍数在2倍以上、FDR值小于0.05为标准,筛选出上调差异表达基因和下调差异表达基因获得差异表达基因211个,其中上调基因120个,下调基因91个;基因富集分析发现差异表达基因集中在黏着斑、TGF-β信号通路等生物过程(P<0.05).结论 顺铂耐药卵巢癌存在一些特异的差异表达基因,有部分信号通路在顺铂耐药卵巢癌中明显富集.

作者:胡万芹;赵洪波;梁宏;赵庆华;杨丽华

来源:昆明医科大学学报 2017 年 38卷 6期

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作者:
胡万芹;赵洪波;梁宏;赵庆华;杨丽华
来源:
昆明医科大学学报 2017 年 38卷 6期
标签:
基因表达谱 顺铂耐药卵巢癌 差异表达基因 富集分析
目的 分析顺铂耐药卵巢癌的差异表达基因和信号通路.方法 用美国国立信息中心NCBI的GEO数据库获得顺铂耐药卵巢癌基因集GSE15372,通过R与Bioconductor软件进行差异表达基因分析;再利用DAVID在线工具对顺铂耐药卵巢癌差异表达基因进行GO本体分析、KEGG通路分析.结果 差异倍数在2倍以上、FDR值小于0.05为标准,筛选出上调差异表达基因和下调差异表达基因获得差异表达基因211个,其中上调基因120个,下调基因91个;基因富集分析发现差异表达基因集中在黏着斑、TGF-β信号通路等生物过程(P<0.05).结论 顺铂耐药卵巢癌存在一些特异的差异表达基因,有部分信号通路在顺铂耐药卵巢癌中明显富集.