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目的 确定1株快速增殖HAV临床分离株HAV302的基因型及其特点.方法 提取培养病毒RNA模板,通过反转录-聚合酶链反应技术扩增该病毒编码区基因并行序列测定,随后利用序列分析软件对其进行序列分析和基因型比对.结果 HAV302株VP1/2A区基因序列与GenBank中收录的HAV Ⅰ型中的ⅠB亚型MBB株核苷酸同源性最高(99.4%).进化树分析显示,HAV302株与MBB株亲缘最近.与MBB株相比,非结构蛋白编码区中的2B和2C区在整个病毒的编码区中变异最大.结论 HAV302株属于HAV Ⅰ型中的ⅠB亚型,其2B和2C区的变异可能是导致病毒快速增殖的原因之一.

作者:白冰珂;胡燕;邬顺全;姜棋予;杨瑞创;柴燕涛;李瑞生;侯俊

来源:传染病信息 2015 年 28卷 3期

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作者:
白冰珂;胡燕;邬顺全;姜棋予;杨瑞创;柴燕涛;李瑞生;侯俊
来源:
传染病信息 2015 年 28卷 3期
标签:
序列分析 甲型肝炎病毒 基因型 sequence analysis hepatitis A virus genotype
目的 确定1株快速增殖HAV临床分离株HAV302的基因型及其特点.方法 提取培养病毒RNA模板,通过反转录-聚合酶链反应技术扩增该病毒编码区基因并行序列测定,随后利用序列分析软件对其进行序列分析和基因型比对.结果 HAV302株VP1/2A区基因序列与GenBank中收录的HAV Ⅰ型中的ⅠB亚型MBB株核苷酸同源性最高(99.4%).进化树分析显示,HAV302株与MBB株亲缘最近.与MBB株相比,非结构蛋白编码区中的2B和2C区在整个病毒的编码区中变异最大.结论 HAV302株属于HAV Ⅰ型中的ⅠB亚型,其2B和2C区的变异可能是导致病毒快速增殖的原因之一.