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本文运用网络药理学方法探讨桑椹的主要活性成分、靶点,初步研究其治疗便秘的药理学作用机制,为进一步深入探讨其药理学作用提供新线索.通过检索数据库的方法筛选出桑椹的主要活性成分、靶点及便秘相关靶点,构建成分-靶点-疾病数据库,导入Cytoscape软件构建网络,获取靶点信息.筛选出关键靶点,利用String进行蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络构建,利用DAVID系统进行GO富集和通路富集分析.从TCMSP数据库中筛选得到桑椹活性成分12种,其作用靶点共370个;从Gene Cards和OMIM疾病相关靶点数据库中检索得到便秘相关靶点452个,取交集后得到桑椹治疗便秘作用靶点共211个.这些靶点主要涉及锌离子结合、氧化还原酶活性、液泡、药物反应与炎症应答等生物学过程,和PPAR信号通路、酒精性肝病、糖尿病并发症AGR受体信号通路、脂质与动脉粥样硬化及流体剪切应力与动脉粥样硬化多条信号通路.本研究发现,网络药理学方法初步揭示了桑椹治疗便秘的主要药理学机制.

作者:郭君鑫;林天宝;吕志强

来源:蚕桑通报 2023 年 54卷 1期

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作者:
郭君鑫;林天宝;吕志强
来源:
蚕桑通报 2023 年 54卷 1期
标签:
桑椹 便秘 网络药理学 通路分析 Mulberry fruits Constipation Network pharmacology Pathway analysis
本文运用网络药理学方法探讨桑椹的主要活性成分、靶点,初步研究其治疗便秘的药理学作用机制,为进一步深入探讨其药理学作用提供新线索.通过检索数据库的方法筛选出桑椹的主要活性成分、靶点及便秘相关靶点,构建成分-靶点-疾病数据库,导入Cytoscape软件构建网络,获取靶点信息.筛选出关键靶点,利用String进行蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络构建,利用DAVID系统进行GO富集和通路富集分析.从TCMSP数据库中筛选得到桑椹活性成分12种,其作用靶点共370个;从Gene Cards和OMIM疾病相关靶点数据库中检索得到便秘相关靶点452个,取交集后得到桑椹治疗便秘作用靶点共211个.这些靶点主要涉及锌离子结合、氧化还原酶活性、液泡、药物反应与炎症应答等生物学过程,和PPAR信号通路、酒精性肝病、糖尿病并发症AGR受体信号通路、脂质与动脉粥样硬化及流体剪切应力与动脉粥样硬化多条信号通路.本研究发现,网络药理学方法初步揭示了桑椹治疗便秘的主要药理学机制.