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目的 筛选在肝细胞癌(HCC)中高表达的免疫相关基因,研究PLXNA1在HCC中的表达差异及其对生物学功能、临床意义和免疫微环境产生的影响.方法 利用TCGA数据库和ImmPort网站分析得到在HCC中高表达的免疫相关基因集.利用单变量COX回归和GEPIA、Kaplan-Meier Plotter网站对其进行分析得到了7个与生存预后相关的基因.通过GEO数据库验证PLXNA1在HCC中的表达情况.基于TCGA数据库,采用Kaplan-Meier、timeROC曲线分析PLXNA1的表达对HCC患者生存预后的影响,通过TIMER网站、CIBERSORT、ssGSEA方法分析PLXNA1的表达与免疫细胞浸润之间的关系.通过IHC实验研究PLXNA1在HCC与癌旁中的表达情况及其对患者生存预后的影响.通过qRT-PCR实验检验其在HCC细胞中的表达情况.利用CCK-8、transwell实验检测si-NC、si-PLXNA1-1、si-PLXNA1-2组中SMMC-7721细胞的增殖、迁移能力.结果 在GSE64041数据集中,PLXNA1在HCC中高表达(P<0.001).TCGA数据库中:PLXNA1可以较为有效的评估患者的预后风险,并且其在HCC中的高表达与患者的预后不良相关(P=0.025).PLXNA1的表达与免疫细胞的浸润程度显著相关(P<0.05).IHC实验结果显示:PLXNA1在HCC组织中高表达,其中PLXNA1高表达组患者的生存率较低(Log-rank P<0.01),PLXNA1的表达对HCC具有显著的诊断

作者:苏莉莉;梁晚晴;吕振宇;韩啸

来源:南方医科大学学报 2023 年 43卷 11期

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作者:
苏莉莉;梁晚晴;吕振宇;韩啸
来源:
南方医科大学学报 2023 年 43卷 11期
标签:
肝细胞癌 PLXNA1 生存预后 生物学功能 免疫浸润 hepatocellular carcinoma PLXNA1 survival prognosis biological function immune infiltration
目的 筛选在肝细胞癌(HCC)中高表达的免疫相关基因,研究PLXNA1在HCC中的表达差异及其对生物学功能、临床意义和免疫微环境产生的影响.方法 利用TCGA数据库和ImmPort网站分析得到在HCC中高表达的免疫相关基因集.利用单变量COX回归和GEPIA、Kaplan-Meier Plotter网站对其进行分析得到了7个与生存预后相关的基因.通过GEO数据库验证PLXNA1在HCC中的表达情况.基于TCGA数据库,采用Kaplan-Meier、timeROC曲线分析PLXNA1的表达对HCC患者生存预后的影响,通过TIMER网站、CIBERSORT、ssGSEA方法分析PLXNA1的表达与免疫细胞浸润之间的关系.通过IHC实验研究PLXNA1在HCC与癌旁中的表达情况及其对患者生存预后的影响.通过qRT-PCR实验检验其在HCC细胞中的表达情况.利用CCK-8、transwell实验检测si-NC、si-PLXNA1-1、si-PLXNA1-2组中SMMC-7721细胞的增殖、迁移能力.结果 在GSE64041数据集中,PLXNA1在HCC中高表达(P<0.001).TCGA数据库中:PLXNA1可以较为有效的评估患者的预后风险,并且其在HCC中的高表达与患者的预后不良相关(P=0.025).PLXNA1的表达与免疫细胞的浸润程度显著相关(P<0.05).IHC实验结果显示:PLXNA1在HCC组织中高表达,其中PLXNA1高表达组患者的生存率较低(Log-rank P<0.01),PLXNA1的表达对HCC具有显著的诊断