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目的 通过高通量转录组测序初步筛选瘢痕疙瘩候选基因.方法 对5例瘢痕疙瘩和正常皮肤组织进行转录组测序,筛选出差异表达基因(DEGs);对DEGs进行差异基因功能(GO)和KEGG富集分析,并对DEGs(NREP,WISP2)进行实时荧光定量PCR验证.结果 瘢痕疙瘩相对正常皮肤组织共476个DEGs,其中175个基因上调,301个基因下调;GO和KEGG分析这些基因主要富集在分子信号相互作用、信号传导、肿瘤、免疫等方面.NREP、WISP2基因的荧光定量PCR结果与测序结果一致.结论 筛选获得了与瘢痕疙瘩形成密切相关的潜在候选基因,为进一步研究瘢痕疙瘩形成的分子机制提供新的基础.

作者:黄谦;张文广;饶忠;蔡纯雁

来源:广东医学 2018 年 39卷 14期

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黄谦;张文广;饶忠;蔡纯雁
来源:
广东医学 2018 年 39卷 14期
标签:
瘢痕疙瘩 转录组测序 差异表达基因
目的 通过高通量转录组测序初步筛选瘢痕疙瘩候选基因.方法 对5例瘢痕疙瘩和正常皮肤组织进行转录组测序,筛选出差异表达基因(DEGs);对DEGs进行差异基因功能(GO)和KEGG富集分析,并对DEGs(NREP,WISP2)进行实时荧光定量PCR验证.结果 瘢痕疙瘩相对正常皮肤组织共476个DEGs,其中175个基因上调,301个基因下调;GO和KEGG分析这些基因主要富集在分子信号相互作用、信号传导、肿瘤、免疫等方面.NREP、WISP2基因的荧光定量PCR结果与测序结果一致.结论 筛选获得了与瘢痕疙瘩形成密切相关的潜在候选基因,为进一步研究瘢痕疙瘩形成的分子机制提供新的基础.