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目的:识别先天性房间隔缺损(ASD)相关 GATA6基因新突变。方法:收集110例先天性 ASD 患者和200名健康对照者的临床资料和血标本,使用 DNA 纯化试剂盒提取基因组 DNA。通过聚合酶链反应扩增 GATA6基因的编码外显子和其两侧的部分内含子,应用双脱氧核苷链末端合成终止法进行 DNA 测序。将所测序列与GenBank 数据库中的 GATA6基因序列进行比对,识别 GATA6基因突变。分别借助在线程序 MUSCLE 和 MutationTaster 评估突变氨基酸的保守性和致病性。结果:在1例家族史阴性的先天性 ASD 患者发现了1种新的 GATA6基因杂合错义突变,即p.Q363E突变,突变率约为0.91%。该突变不存在于200名健康对照者,多物种序列比对显示,被改变氨基酸在进化上高度保守,致病性预测表明这种变异为致病性突变。结论:发现 ASD 相关 GATA6基因新突变,有助于揭示 ASD 新的分子机制。

作者:徐蕾;袁方;李若谷;曲新凯;仇兴标;杨奕清

来源:国际心血管病杂志 2014 年 2期

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作者:
徐蕾;袁方;李若谷;曲新凯;仇兴标;杨奕清
来源:
国际心血管病杂志 2014 年 2期
标签:
先天性心脏病 房间隔缺损 遗传学 转录因子 GATA6 Congenital heart disease Atrial septal defect Genetics Transcriptional factor GATA6
目的:识别先天性房间隔缺损(ASD)相关 GATA6基因新突变。方法:收集110例先天性 ASD 患者和200名健康对照者的临床资料和血标本,使用 DNA 纯化试剂盒提取基因组 DNA。通过聚合酶链反应扩增 GATA6基因的编码外显子和其两侧的部分内含子,应用双脱氧核苷链末端合成终止法进行 DNA 测序。将所测序列与GenBank 数据库中的 GATA6基因序列进行比对,识别 GATA6基因突变。分别借助在线程序 MUSCLE 和 MutationTaster 评估突变氨基酸的保守性和致病性。结果:在1例家族史阴性的先天性 ASD 患者发现了1种新的 GATA6基因杂合错义突变,即p.Q363E突变,突变率约为0.91%。该突变不存在于200名健康对照者,多物种序列比对显示,被改变氨基酸在进化上高度保守,致病性预测表明这种变异为致病性突变。结论:发现 ASD 相关 GATA6基因新突变,有助于揭示 ASD 新的分子机制。