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目的 基于网络药理学方法预测红花治疗心肌缺血的潜在靶点及信号通路.方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台筛选红花中口服生物利用度≥30%和类药性≥0.18的活性成分及作用靶点.采用OMIM数据库和GeneCards数据库检索心肌缺血相关疾病靶点.获取红花中有效成分的靶点和心肌缺血疾病相关靶基因的共同靶基因.针对共同靶基因,通过在线STRING平台构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,采用Cytoscape软件构建可视化的"化合物-靶点-通路"网络,并进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.结果 筛选得到22种潜在的药效成分,218个化合物靶点,531个心肌缺血相关靶基因;后两者取交集后获得39个共同靶点.PPI网络自由度较高的节点为白细胞介素(IL)-6、白蛋白、血管内皮生长因子A、丝裂原激活蛋白激酶8、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3.GO功能富集分析得到48个GO条目,KEGG通路富集分析得到114条信号通路.结论 红花可能是通过调节激活转录因子结合、雌激素受体结合、半胱氨酸型内肽酶活性、核激素受体结合、DNA结合转录激活活性等靶点,调控流体切应力和动脉粥样硬化、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染、糖尿病并发症的年龄愤怒信号、IL-17信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等相关通路,从而达到对

作者:谢巍;杨妮;肖萍;黄艳玲

来源:广西医学 2020 年 42卷 9期

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作者:
谢巍;杨妮;肖萍;黄艳玲
来源:
广西医学 2020 年 42卷 9期
标签:
心肌缺血 红花 网络药理学 靶点 信号通路 预测 功能
目的 基于网络药理学方法预测红花治疗心肌缺血的潜在靶点及信号通路.方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台筛选红花中口服生物利用度≥30%和类药性≥0.18的活性成分及作用靶点.采用OMIM数据库和GeneCards数据库检索心肌缺血相关疾病靶点.获取红花中有效成分的靶点和心肌缺血疾病相关靶基因的共同靶基因.针对共同靶基因,通过在线STRING平台构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,采用Cytoscape软件构建可视化的"化合物-靶点-通路"网络,并进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.结果 筛选得到22种潜在的药效成分,218个化合物靶点,531个心肌缺血相关靶基因;后两者取交集后获得39个共同靶点.PPI网络自由度较高的节点为白细胞介素(IL)-6、白蛋白、血管内皮生长因子A、丝裂原激活蛋白激酶8、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3.GO功能富集分析得到48个GO条目,KEGG通路富集分析得到114条信号通路.结论 红花可能是通过调节激活转录因子结合、雌激素受体结合、半胱氨酸型内肽酶活性、核激素受体结合、DNA结合转录激活活性等靶点,调控流体切应力和动脉粥样硬化、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染、糖尿病并发症的年龄愤怒信号、IL-17信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等相关通路,从而达到对