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滇龙胆主要药效成分为龙胆苦苷,而8-羟香叶醇氧化还原酶基因Gr8HGO是龙胆苦苷生物合成途径的结构基因.为了研究Gr8HGO基因的功能,该文克隆了滇龙胆Gr8HGO基因,并进行表达分析.结果表明:(1)共克隆到 5 个 Gr8HGO 基因,其 GenBank 登录号分别为 KP722029.1(Gr8HGO-1)、KP722030.1(Gr8HGO-2)、KP722031.1(Gr8HGO-3)、KP722032.1(Gr8HGO-4)、KP723852.1(Gr8HGO-5).(2)Gr8HGO-1基因全长1 062 bp,编码353个氨基酸,其他4个基因全长1 131 bp,编码376个氨基酸;理化性质分析结果表明5个蛋白单体相对分子质量约40 kD,理论等电点在5.47~5.95之间,均为疏水稳定蛋白.(3)信号序列分析结果表明5个蛋白均不含信号肽、跨膜螺旋和叶绿体转运肽;亚细胞定位分析结果表明5个蛋白可能定位于细胞质;结构域预测结果表明除Gr8HGO-1蛋白仅包含乙醇脱氢酶N端结构域(IPR013154)和C端结构域(IPR013149)外,其他4个蛋白还包含聚酮合酶、烯酰还原酶结构域(IPR020843).(4)系统发育分析结果表明这些Gr8HGO蛋白与长春花Cr8HGO蛋白亲缘关系最近.(5)qPCR结果表明Gr8HGO基因主要在叶中表达,在根和茎中表达量很低.该研究为后续龙胆苦苷生物合成途径的解析奠定基础.

作者:王伟妍;李彩霞;李湫;鄢秋紫;张晓东

来源:广西植物 2020 年 40卷 2期

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作者:
王伟妍;李彩霞;李湫;鄢秋紫;张晓东
来源:
广西植物 2020 年 40卷 2期
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滇龙胆 8-羟香叶醇氧化还原酶 克隆 生物信息学 基因表达
滇龙胆主要药效成分为龙胆苦苷,而8-羟香叶醇氧化还原酶基因Gr8HGO是龙胆苦苷生物合成途径的结构基因.为了研究Gr8HGO基因的功能,该文克隆了滇龙胆Gr8HGO基因,并进行表达分析.结果表明:(1)共克隆到 5 个 Gr8HGO 基因,其 GenBank 登录号分别为 KP722029.1(Gr8HGO-1)、KP722030.1(Gr8HGO-2)、KP722031.1(Gr8HGO-3)、KP722032.1(Gr8HGO-4)、KP723852.1(Gr8HGO-5).(2)Gr8HGO-1基因全长1 062 bp,编码353个氨基酸,其他4个基因全长1 131 bp,编码376个氨基酸;理化性质分析结果表明5个蛋白单体相对分子质量约40 kD,理论等电点在5.47~5.95之间,均为疏水稳定蛋白.(3)信号序列分析结果表明5个蛋白均不含信号肽、跨膜螺旋和叶绿体转运肽;亚细胞定位分析结果表明5个蛋白可能定位于细胞质;结构域预测结果表明除Gr8HGO-1蛋白仅包含乙醇脱氢酶N端结构域(IPR013154)和C端结构域(IPR013149)外,其他4个蛋白还包含聚酮合酶、烯酰还原酶结构域(IPR020843).(4)系统发育分析结果表明这些Gr8HGO蛋白与长春花Cr8HGO蛋白亲缘关系最近.(5)qPCR结果表明Gr8HGO基因主要在叶中表达,在根和茎中表达量很低.该研究为后续龙胆苦苷生物合成途径的解析奠定基础.