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ERF(Ethylene-responsive factor)是一类具有AP2特征结构域的乙烯应答转录因子,在响应植物的逆境胁迫应答中起关键作用.为明确ERF家族成员TOE3在烟草中的生物学功能和调控机制,同源克隆普通烟草K326中NtTOE3基因cDNA全长,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)表征基因表达模式,结合生物信息学分析,对基因功能和调控机制进行初步预测.结果表明,该基因全长1 356 bp,编码451个氨基酸残基,预测分子量为49.84 ku.生物信息学分析表明,该蛋白是一个亲水蛋白,可能定位在细胞核,且与美花烟草(Nicotiana sylvestris)NsTOE3有96%的同源性,故命名为NtTOE3.组织表达分析发现,该基因在烟草根、茎、叶、花中均有表达,其中茎中表达量最高.逆境胁迫试验表明,该基因能快速响应低钾、高盐、干旱、H2O2、ABA和4℃等逆境处理.表明NtTOE3转录因子在烟草非生物胁迫中起着重要调节作用.

作者:卓维;陈倩;罗银;杨尚谕;鲁黎明;李立芹

来源:植物研究 2018 年 38卷 5期

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作者:
卓维;陈倩;罗银;杨尚谕;鲁黎明;李立芹
来源:
植物研究 2018 年 38卷 5期
标签:
烟草 NtTOE3 克隆 生物信息学 基因表达
ERF(Ethylene-responsive factor)是一类具有AP2特征结构域的乙烯应答转录因子,在响应植物的逆境胁迫应答中起关键作用.为明确ERF家族成员TOE3在烟草中的生物学功能和调控机制,同源克隆普通烟草K326中NtTOE3基因cDNA全长,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)表征基因表达模式,结合生物信息学分析,对基因功能和调控机制进行初步预测.结果表明,该基因全长1 356 bp,编码451个氨基酸残基,预测分子量为49.84 ku.生物信息学分析表明,该蛋白是一个亲水蛋白,可能定位在细胞核,且与美花烟草(Nicotiana sylvestris)NsTOE3有96%的同源性,故命名为NtTOE3.组织表达分析发现,该基因在烟草根、茎、叶、花中均有表达,其中茎中表达量最高.逆境胁迫试验表明,该基因能快速响应低钾、高盐、干旱、H2O2、ABA和4℃等逆境处理.表明NtTOE3转录因子在烟草非生物胁迫中起着重要调节作用.