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目的 运用网络药理学及分子对接技术探讨千层纸素A治疗椎间盘退变的作用机制.方法 通过PharmMapper、SwissTarget Prediction和Similarity ensemble approach数据库获取千层纸素A的药物作用靶点.在GeneCards和在线人类孟德尔遗传数据库搜索椎间盘退变疾病相关靶点.在此基础上,将千层纸素A的作用靶点与椎间盘退变疾病靶点取交集得到千层纸素A对椎间盘退变的潜在治疗靶点.运用在线String数据库和Cytoscape 3.8.0软件构建蛋白相互作用网络,运用R语言对共同靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,使用AutoDock vina软件对千层纸素A与关键靶点进行虚拟对接.结果 通过筛选共得到35个千层纸素A对椎间盘退变的潜在治疗靶点.靶点涉及的通路主要包括PI3K/AKT信号通路、IL-17信号通路、TNF信号通路以及糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路.结合蛋白相互作用网络和KEGG富集分析共得到白细胞介素-6(IL-6)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、表皮生长因子受体(EGFR)和基质金属蛋白酶9(MMP9)4个核心靶点,与千层纸素A进行分子对接,结果显示亲和力均小于-5 kcal·mol-1,分子对接结果良好.结论 本研究采用网络药理学和分子对接的方法,揭示出千层纸素A可能通过抑制髓核细胞凋亡、抑制细胞外基质降解、抗炎和

作者:刘明阳;赵翔;张宇;张锴广;高延征

来源:河南医学研究 2023 年 32卷 2期

知识库介绍

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作者:
刘明阳;赵翔;张宇;张锴广;高延征
来源:
河南医学研究 2023 年 32卷 2期
标签:
椎间盘退变 千层纸素A 网络药理学 分子对接
目的 运用网络药理学及分子对接技术探讨千层纸素A治疗椎间盘退变的作用机制.方法 通过PharmMapper、SwissTarget Prediction和Similarity ensemble approach数据库获取千层纸素A的药物作用靶点.在GeneCards和在线人类孟德尔遗传数据库搜索椎间盘退变疾病相关靶点.在此基础上,将千层纸素A的作用靶点与椎间盘退变疾病靶点取交集得到千层纸素A对椎间盘退变的潜在治疗靶点.运用在线String数据库和Cytoscape 3.8.0软件构建蛋白相互作用网络,运用R语言对共同靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,使用AutoDock vina软件对千层纸素A与关键靶点进行虚拟对接.结果 通过筛选共得到35个千层纸素A对椎间盘退变的潜在治疗靶点.靶点涉及的通路主要包括PI3K/AKT信号通路、IL-17信号通路、TNF信号通路以及糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路.结合蛋白相互作用网络和KEGG富集分析共得到白细胞介素-6(IL-6)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、表皮生长因子受体(EGFR)和基质金属蛋白酶9(MMP9)4个核心靶点,与千层纸素A进行分子对接,结果显示亲和力均小于-5 kcal·mol-1,分子对接结果良好.结论 本研究采用网络药理学和分子对接的方法,揭示出千层纸素A可能通过抑制髓核细胞凋亡、抑制细胞外基质降解、抗炎和