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目的 探讨肿瘤微环境中CD4+T细胞不同亚型对结肠癌进展的差异调控作用,以及免疫细胞亚群组分与结肠癌疾病进程的相关性.方法 利用基因表达数据库(GEO)中的结肠癌单细胞测序数据,基于CIBERSORTx算法对癌症基因组图谱(TCGA)数据库中结肠癌患者队列的表达谱数据进行免疫细胞亚群评分.将获得的免疫细胞亚群评分与临床资料结合,进行转移预后相关分析.基于免疫细胞亚群评分筛选高度相关基因,使用功能富集分析数据库(DAVID)分析平台进行功能聚类,比较免疫细胞亚群对结肠癌细胞功能调控的差异.采用LASSO回归筛选免疫细胞亚群,并用Cox分析构建风险预后模型.结果 与TCGA结肠癌未转移患者比较,转移患者hT04_CD4-TCF7浸润评分升高(P<0.01),hT11_CD4-CTLA4、hT12_CD8-LEF1、hB01_PlasmaB-IgG、hM10_Macro-IL1B浸润评分下降(P<0.05).在生存分析中,38个免疫细胞亚群中有15个亚群与患者总生存期明显相关(P<0.05).比较分析CD4+T细胞亚群对结肠癌细胞的调控功能发现,CD4-GNLY、CD4-ANXA1、CD4-CXCR6亚群对结肠癌肿瘤的调控作用优先聚集在血管生成相关通路,CD4-IL23R优先聚集在能量代谢相关通路,CD4-GZMK优先聚集在缺氧应激相关通路,CD4-ANXA1、CD4-TCF7、CD4-CTLA4优先聚集在细胞增殖相关通路,CD4-ANXA1、CD4-TCF7、CD4-CTL

作者:周彦彤;李春晓;王劲松;孙芳洲;许东奎;张雪燕;袁芃;钱海利

来源:解放军医学杂志 2021 年 46卷 7期

知识库介绍

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作者:
周彦彤;李春晓;王劲松;孙芳洲;许东奎;张雪燕;袁芃;钱海利
来源:
解放军医学杂志 2021 年 46卷 7期
标签:
结肠癌 癌症基因组图谱 肿瘤微环境 转录组测序 免疫细胞亚群
目的 探讨肿瘤微环境中CD4+T细胞不同亚型对结肠癌进展的差异调控作用,以及免疫细胞亚群组分与结肠癌疾病进程的相关性.方法 利用基因表达数据库(GEO)中的结肠癌单细胞测序数据,基于CIBERSORTx算法对癌症基因组图谱(TCGA)数据库中结肠癌患者队列的表达谱数据进行免疫细胞亚群评分.将获得的免疫细胞亚群评分与临床资料结合,进行转移预后相关分析.基于免疫细胞亚群评分筛选高度相关基因,使用功能富集分析数据库(DAVID)分析平台进行功能聚类,比较免疫细胞亚群对结肠癌细胞功能调控的差异.采用LASSO回归筛选免疫细胞亚群,并用Cox分析构建风险预后模型.结果 与TCGA结肠癌未转移患者比较,转移患者hT04_CD4-TCF7浸润评分升高(P<0.01),hT11_CD4-CTLA4、hT12_CD8-LEF1、hB01_PlasmaB-IgG、hM10_Macro-IL1B浸润评分下降(P<0.05).在生存分析中,38个免疫细胞亚群中有15个亚群与患者总生存期明显相关(P<0.05).比较分析CD4+T细胞亚群对结肠癌细胞的调控功能发现,CD4-GNLY、CD4-ANXA1、CD4-CXCR6亚群对结肠癌肿瘤的调控作用优先聚集在血管生成相关通路,CD4-IL23R优先聚集在能量代谢相关通路,CD4-GZMK优先聚集在缺氧应激相关通路,CD4-ANXA1、CD4-TCF7、CD4-CTLA4优先聚集在细胞增殖相关通路,CD4-ANXA1、CD4-TCF7、CD4-CTL